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猪繁殖与呼吸综合征作为一种高度接触性传染病，由猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcinereproductiveandrespiratorysyndromevirus，PRRSV)引起。该病的主要特征是母猪繁殖障碍，仔猪呼吸道症状及断奶仔猪高死亡率。其在世界范围内的流行，给世界各国的养猪业造成了沉重的打击。特别是2006年我国南方省份暴发的PRRSV变异株引起的“猪高热病”给我国的养猪业造成巨大的经济损失。
本研究对广西2008-2010年送检的1689份样品进行检测，阳性样品一共411份，阳性率达到24.3％，其中变异株295株，阳性率为17.5％；传统株37株，阳性率为2.2％；混合感染79株，阳性率为4.7％。在PRRSV阳性中，变异株所占比重为71.8％，传统株所占比重为9％，混合感染所占比重为19.2％。筛选部分PRRSV阳性样品，进行Nsp2基因全长的扩增及序列比对分析，总共获得35个Nsp2全长基因，其核苷酸同源性为89.7％-99.7％，与VR-2332的同源性为80.5％-83.7％，与CH-1a的同源性为89.6％-92.3％，与JXA1的同源性为92％-99.3％；Nsp2基因间推导的氨基酸同源性为84.8％-99.7％，与VR-2332的同源性分别为74.5％-78％，与CH-1a的同源性分别为84.4％-88.4％，与JXA1的同源性分别为88.2％-99.1％。Nsp2基因推导的氨基酸位点变异分析表明，与美洲型代表毒株VR-2332相比，35个序列中，有32个Nsp2推导氨基酸序列在481位和533-561位共同发生了不连续的30个氨基酸缺失，其中GXNN03-2010在12-14位额外缺失了3个氨基酸，GXNN01-2009、GXNN02-2009在485-488位额外缺失4个氨基酸。另外，GXNN07-2009在468位缺失1个氨基酸。核苷酸序列系统进化树分析表明，本研究所得35个Nsp2基因主要分属以HB-1为代表的亚群3和以JXA1为代表的亚群4。
通过病毒分离，本研究获得GX59-2008、GX12-2009两株HP-PRRSV，全基因组测序表明，GXNN59-2008基因组全长为15332bp，GXNN12-2009基因组全长为15325bp，2株间全基因组核苷酸序列的同源性为98％，与LV株的同源性分别为60.7％、60.6％，与VR-2332的同源性分别为89.5％、88.9％，与JXA1的同源性分别为98.9％、98.3％。通过全基因组主要氨基酸位点分析，本研究所得2个毒株均属于野毒株。9个毒力相关氨基酸位点除了发生与HP-PRRSV一致的ORF3G83→S83外，其余8个均未发生变异。基因组进化树分析可知，这2个毒株均属于HP-PRRSV。