‘京红’桃及其晚熟芽变果实发育特征和转录组测序分析

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桃(Prunus persica L.)是蔷薇科、桃属植物,原产中国,栽培历史悠久,品种资源丰富。桃属于呼吸跃变型的果实,其果实软化、果实酸度、可溶性固性物含量等性状是由成熟期基因控制。本课题组发现了早熟‘京红’桃中的一株晚熟芽变,其芽变成熟期比母株晚熟近19 d。本研究以‘京红’及晚熟芽变的果实为试材,通过比较转录组学,对不同发育阶段果实的转录组测序分析以及生理指标的变化规律进行综合分析,进行了桃成熟过程中各种激素代谢通路相关基因的筛选。主要研究结果如下:1.芽变与亲本间的纵横径、单果重的生长变化规律基本上呈“双S”型不断增加。二者花期相同,但‘京红’果实的增长速率显著高于芽变,并发现芽变在果实缓慢生长期的时间比亲本超出15 d,在第二次生长高峰期芽变持续时间也比亲本长,芽变的整个果实发育时期比‘京红’延长了19 d。芽变软化速度和成熟时的软化程度低于亲本。可溶性固形物积累速率变化趋势相似,叶绿素和类胡萝卜素含量在芽变的下降速度比亲本慢,最终含量也低于亲本。花色素苷和类黄酮含量在两个品种中则呈先下降再升高的趋势,在果实成熟期含量均大于亲本。2.四种内源激素在两组材料的变化规律也存在差异。ABA含量在‘京红’桃及其芽变果实的变化趋势一致,但芽变上升速度较晚,达到顶峰的时间比‘京红’迟13 d;在果实成熟时的相对含量高于亲本。Eth在‘京红’桃及芽变果实发育过程中呈上升趋势,但芽变上升时间比‘京红’晚20 d。IAA和GA3在‘京红’桃及其芽变果实含量变化整体均呈下降趋势,且在芽变中的下降速度相对较慢,含量高于‘京红’,‘京红’成熟时的IAA和GA3含量较高于芽变。3.通过不同成熟期的‘京红’桃品种及晚熟芽变进行转录组测序分析,获得152.85 Gb Clean Data,各文库均达到6.68 Gb以上,Q30碱基百分比均大于93.03%,各文库获得了44796972万条Clean reads片段;分别将其与桃参考基因组进行序列比对,比对率为96.26%97.5%;最终获得转录本共45296个,其中已知转录本33075个,新转录本12221个;共检测到表达基因共23419个,其中已知基因22625个,新基因794个。4.DEGs显著富集的代谢途径中,AUX、ABA、CK、JA和Eth激素途径中所涉及的基因在果实发育过程中发挥重要作用。根据显著富集在通路的DEGs中共挖掘到85个与果实成熟相关的DEGs,包括68个植物激素信号转导基因、16个类胡萝卜素合成基因、14个类黄酮合成基因、5个苯丙胺代谢基因和28个转录因子。通过qRT-PCR验证筛选出24个DEGs,发现基因的相对表达水平与转录组数据相似的趋势。对‘京红’及其晚熟芽变果实成熟相关基因进行了初步的研究探索,为后续更深入的激素信号转导相关基因功能以及基因共表达网络对桃成熟期的分子调控机制研究提供理论支持。
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