近年来，政府、企业和公众对气象服务的要求和期望随着经济和社会的发展进步越来越高，在党中央、国务院的高度重视下，我国气象事业取得了长足发展。随着国家财政对公共气象服务的投入不断加大，气象部门内部审计在加强部门管理、改善内部控制、提高经济效益、推动组织健全自我约束机制、防范管理和经营风险、保证气象现代化建设目标实现等方面具有不可替代的作用。随着气象事业不断发展，探讨内部控制视角下的气象部门内部审计，对气象部门改进内部审计工作、提升内部审计质量、提升内部审计人员素质都有着积极意义。实现内部控制视角下的气象部门内部审计，是实现我国气象现代化建设目标的有力保证。　　本文从内部审计在内部控制工作中的重要性出发，通过对内部控制与内部审计及其相关性的理论分析，分析了气象部门内部审计的现状和存在的问题。针对气象部门的管理和业务特点，通过定性和定量的方法，研究了基于内部控制视角的内部审计优化在气象部门经济责任审计、财务收支审计、建设项目审计、专项审计等气象部门内部审计项目中的应用，并选取S省气象局的一个审计项目为例，对基于内部控制视角的气象部门内部审计进行了案例分析，验证基于内部控制视角的气象部门内部审计优化理论的操作性，为行政事业单位加强内部审计与内部控制提供参考。