转录组测序揭示DKK4与胰腺癌密切相关

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背景:近年来研究发现DKK4与肿瘤的发生密切相关。在结肠癌、肾癌组织中DKK4高表达促使肿瘤的发生发展,但DKK4与胰腺癌的关系不清楚。方法:采用q RT-PCR和免疫组化检测了DKK4在胰腺癌组织中的表达情况。构建过表达DKK4的胰腺癌细胞株通过转录组测序发现基于DKK4引起的差异基因。通过差异基因注释、差异基因信号通路分析及信号通路互作、差异基因互作网络分析、共表达分析揭示DKK4与胰腺癌密切相关。采用胰腺癌标本冰冻切片和石蜡连续切片通过免疫组化和免疫荧光去验证分析的正确性。最后,通过体内外分子实验探索DKK4在胰腺癌中的生物学行为。结果:q RT-PCR和免疫组化结果显示DKK4在胰腺癌组织中高表达。转录组测序结果发现过表达DKK4的胰腺癌细胞株PANC-1-DKK4有520个基因上调,有115个基因下调。基因功能注释及信号通路分析发现差异基因主要富集在与肿瘤,器官发育,免疫炎症有关的条目上。信号通路互作揭示过表达DKK4的胰腺癌细胞株中MAPK signaling pathway是富集显著的核心信号转导通路。Western blot显示在过表达DKK4胰腺癌细胞株中磷酸化的ERK表达明显升高,表明MAPK signaling pathway活性升高。通过差异基因的互作分析及共表达分析发现与肿瘤密切相关的基因,如MAPK3、PIK3R3、VAV3、JAG1、PIK3R5、PITX3。在胰腺癌组织中免疫组化提示DKK4与MAPK3、VAV3表达正相关,免疫荧光显DKK4可以分别与MAPK3、VAV3共表达。细胞小室实验证明DKK4可以增加胰腺癌细胞侵袭迁移能力。胰腺癌原位种植动物模型显示DKK4可明显促进胰腺癌的肝转移效应。结论:我们首次发现胰腺癌组织中DKK4高表达。通过转录组织测序及生物学信息分析在过表DKK4的胰腺癌细胞株中发现与肿瘤密切相关的癌基因,MAPK signaling pathway是过表达DKK4胰腺癌细胞株PANC-1-DKK4显著活化的核心信号转导通路,体内外实验证明DKK4促进胰腺癌细胞的侵袭迁移。提示DKK4与胰腺癌的发生密切相关,可作为胰腺癌治疗的新靶点。
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