RNA聚合酶暂停在基因的启动子区域产生功能未知新生小RNA,而RNA聚合酶进入转录延伸阶段需要招募转录延伸因子(P-TEFb)。在HIV感染过程中,病毒编码的蛋白Tat,通过结合病毒新生RNA上的TAR元件,将P-TEFb从没有活性的7SK复合体中转运到RNA聚合酶上,从而激活HIV病毒的转录,但是细胞中是否运用相似的机制去激活细胞基因的转录目前尚不清楚。这里我们提供证据显示：SC35(也叫做SRSF2)与SC35结合的启动子附近的转录本在促进转录暂停再延伸的过程中,与HIV Tat和TAR类似。这一发现揭示了以前未知的转录和剪接偶联机制,转录起始位点周围的小RNA功能,和同时存在于病毒和细胞中的一种独特的转录激活机制。科学家们以前尝试用各种方法在体内和体外测定RNA聚合酶转录速度,但是到目前为止,还没有方法能够在全基因组范围内测定RNA聚合酶的转录速度。现在我们开发了一种方法,配合上GRO-seq技术,在小鼠的成纤维细胞中测定了全基因组范围内RNA聚合酶的转录速度。运用该方法我们惊奇地发现,SC35敲除以后RNA聚合酶的转录速度和基因内部的转录效率降低了。这些结果用一种全所未有的视角揭示了转录和RNA剪接的亲密偶联过程。越来越多的证据表明,组蛋白修饰可以通过剪接因子调控前体mRNA剪接过程。但是对于剪接因子如何影响上游的转录组分目前仍然很不清楚。本课题中的研究发现,SC35敲除后,组蛋白H3K36me3水平明显增加,多种转录成员从染色体上解离下来,RNA聚合酶的泛素化水平明显增加。这些结果表明SC35可能是一个潜在的转录激活因子,对转录机器的稳定性至关重要。