蜂猴(Nycticebus bengalensis)系夜行、树栖的小型低等灵长类。蜂猴的野外种群广泛分布于印度东南部、孟加拉东部、缅甸、越南中部和北部、老挝、柬埔寨、泰国、马来西亚半岛北部和中国南部。蜂猴的自然种群在中国仅分布在云南南部、东南部、西南部以及广西南部地区,亦是蜂猴全球分布的北缘。蜂猴是国家一级保护动物,CITES附录I物种,由于栖息地破坏和非法贸易的泛滥,被IUCN濒危物种红色名录评级为易危(VU)。本研究以蜂猴圈养种群为研究对象,利用分子粪便学测定了一条完整的蜂猴线粒体基因组序列,验证了分子粪便学的实用性和有效性,同时测序51条Cyt b基因全序列和48条D-loop区部分序列,分析其圈养种群来源、序列特征和遗传信息。本研究发现(1)蜂猴线粒体基因组全序长16,770 bp,由13个蛋白质编码基因、2个r RNA基因、22个穿插于r RNA和蛋白质编码基因间的t RNA共37个基因加一个非编码区(线粒体DNA控制区D-loop)共38个部分组成,为一个闭合的双链环状分子,符合一般哺乳动物线粒体DNA的结构。同时碱基组成有AT偏向,蛋白质编码基因的起始密码子有ATG偏向。(2)本次研究在63条Cyt b序列中一共定义了33种单倍型,而在59条D-loop区序列中一共定义出了36条单倍型,计算出蜂猴遗传多样性较低,具有高的单倍型多样性和低的核苷酸多样性。(3)通过对蜂猴各单倍型之间的遗传距离计算,在Cyt b基因的33种单倍型中遗传距离为0.001-0.022,D-loop区36个单倍型之间的遗传距离在0.003-0.049之间。圈养蜂猴群体间出现遗传分化,但需要更多的数据来丰富,同时圈养蜂猴的遗传多样性较低,急需关注和有效的保护。