枸杞瘤瘿螨在枸杞产区普遍发生并对枸杞产生危害,主要侵害枸杞叶、嫩茎、腋芽等部位。枸杞受侵后常常会形成隆起的虫瘿以及畸形叶片。严重时会影响植物叶片光合作用导致枸杞产量下降。本文对在中国枸杞产区采到的3种瘤瘿螨进行形态和分子鉴定并解决他们在分类上的争议,进一步利用线粒体COI和核糖体28S进行枸杞瘤瘿螨的种群结构及遗传多样性分析,最后评价了这些DNA序列在分子鉴定和遗传多样性研究上的实用性。(1)依据瘿螨形态鉴定系统,对3个柏杞种植区12个地理种群进行鉴定,发现只有白构杞瘤瘿螨(Aceriapallida),构杞金氏瘤癭螨(A.tiyingi),拟大枸杞瘤瘿螨(A.paramacrodonis)。三者在分类地位上存在争议,尝试利用线粒体COI和核糖体28S序列标记来解决。K2P遗传距离和Haplotype network分析结果显示三个种种间的距离都明显小于2%且存在共享单倍型,故而认定这三个种为同一个种。(2)基于COI标记,得到449bp的序列片段。变异位点43个,具有37个单倍型,Hd从0.34167(广东)至0.81287(甘肃)。所有地理种群Hd平均值为0.648,其中甘肃和青海种群相对其他地区高。单倍型H1在各个地理种群均有分布。Pi从0.00106(广东)到0.00482(新疆),所有种群的Pi平均值为0.00234±0.001。同样甘肃和青海地区多样性也相对比较高;基于28S的分子标记,得468bp序列片段,具有23单倍型,22个变异位点。甘肃和青海地区具很高单倍型多样性,大部分地理种群都含有单倍型HI,H2和H3。其中H1在所有地理种群中都有分布,占有很高频率。Hd从0(新疆,宁夏)至0.594(甘肃)。种群均值0.394;Pi从0(新疆,宁夏)至0.0031(甘肃),平均值为0.0013±0.001,且Hd和Pi都显示甘肃和青海有很高的遗传多样性。我们推测甘肃和青海可能是虫源地。(3)基于COI标记,Fst指数揭示河北,新疆种群与多数其他地理种群之间产生明显分化,且达到了显著水平。IBD分析表明这些种群分化跟地理距离有一定的联系。AMOVA分析也表明枸杞瘤瘿螨种群呈现低水平的种群分化,种群之间存在很强的基因流。错配分布,中性检测(除了河北)都显示种群近期有过扩张的历史。对三个枸杞产区间种群基因流估算,表明三个种植区之间存在种群或者个体的相互迁移;基于28S标记,甘肃瓜州,甘肃景泰,河北种群与其他种群产生低水平的种群分化,达到显著水平。但是IBD分析并没有表现出相关联系。AMOVA,中性检测,错配分布等分析结果都显示出与COI标记类似结果。对三个枸杞产区基因流分析,发现西北枸杞产区的瘿螨种群对其他产区有较大侵入,这可能是与枸杞引种栽培有关。