论文部分内容阅读
新疆北鲵(Ranodon sibiricus),属两栖纲,有尾目,小鲵科,北鲵属。仅分布在新疆温泉县和哈萨克斯坦两国边境处极狭窄区域。形态学及分子系统学分析表明,新疆北鲵是有尾目中最原始的类群之一,进化地位十分重要。然而这种珍稀的有尾两栖类却处在灭绝的边缘,对该物种进行保护遗传学研究己刻不容缓。
本研究从我国境内目前已发现的5个北鲵栖息地中共采集103个样品,代表了新疆北鲵的主要群体。采用PCR、克隆、测序技术,获得其中55个样品的线粒体DNA的tRNA-Thr、tRNA-Pro、tRNA-Phe、D-loop区及部分Cytb和12S rRNA序列,长度约1323 bp。为了分析基因分型实验过程中误差对分析结果的影响,我们随机抽取了部分样品进行重复实验,结果表明整个实验过程中产生的误差水平是0.0022。推测这些误差可能是由测序或重组质粒在E.coli中复制产生的。
新疆北鲵线粒体D-loop区长度约799 bp,碱基A+T含量平均约为66.83%,与中国大鲵的相似。新疆北鲵群体的多态性分析显示其序列D-loop区没有多态位点。
新疆北鲵如此低的分子多态性,这在其他物种是极少见的。我们推测造成这种现象的原因主要有两个:第一,新疆北鲵的种群数量非常小,并且呈持续下降的趋势;第二,在第四纪冰川期时,温度下降使北鲵栖息地由高海拔向低海拔移动,达到冰期避难所,各群体间在此发生显著的基因交流,冰期过后又重新形成目前的间断分布。如此低的多态水平也表明新疆北鲵的物种延续存在很大危险。
本研究是国内首次利用D-loop区对新疆北鲵做群体水平上的多样性分析,为新疆北鲵保护策略的制定提供了理论依据。