在当今世界经济发展的过程中出现了两大趋势，那就是经济全球化和区域经济一体化，中国与中亚五国的农产品贸易的发展，既是经济全球化与区域一体化的集中表现，也是崛起中的中国与中亚五国进一步发展的有益选择。1996年4月，上海合作组织的建立，为中国和中亚国家的发展注进了新鲜血液。2013年9月，“丝绸之路经济带”的提出，进一步带动了中国与中亚五国的发展。对于中亚五国来说，由于全球金融危机的原因，加之正处于经济体制转型的新时期，各项贸易措施的负面影响也在凸显，提升中国与中亚五国的农产品贸易便利化以促进中国与中亚五国的贸易是未来国际贸易的发展方向。本文中以贸易便利化的理论知识为基础，分析了中国与中亚五国的农产品贸易现状，并从口岸物流、海关环境、规章制度和商务环境四个方面全面探究了中国与中亚五国的农产品贸易便利化现状及问题。在此基础上，运用问卷调查统计的数据和世界经济论坛的统计数据，分析中国与中亚五国农产品贸易的影响因素，借鉴发达国家的贸易便利化经验，提出推动中国与中亚五国贸易便利化的运行机制。本文通过模型的实证分析和问卷的定性分析，均得出贸易便利化的发展对农产品的贸易影响重大。尽管中国的农产品贸易便利化水平整体高于中亚五国的水平，但中国与中亚五国农产品贸易便利化的水平较低，可见中国与中亚五国在贸易便利化方面的道路还很长。在全面分析贸易便利化现状基础上，提出推动农产品贸易便利化的机制，在国内设计了包括政府机关、相关企业、行业协会和学术团体在内的四位一体运行路径。在和中亚五国合作方面，建立推动中国与中亚五国农产品贸易便利化的合作委员会，建立多层次、网络状的区域协调体系。