创新是区域经济发展的根本动力源；区域创新系统的形成与发展是增强区域自主创新能力,建设创新型区域的捷径。作为转型的发展中大国,中国区域创新系统发展具有不平衡性。先发地区的创新系统经验和模式对后发地区具有极强的示范效应和借鉴意义。虽然,区域创新效率增进方式多种多样,但是,相对于传统来讲,现代科技研究交叉融合性和创新的复杂性、不确定性所引致的创新协同信息成本畸高,致使创新协同度提升成为降低信息成本、增进区域创新效率的关键。长江三角洲地区是我国综合实力最强的区域,尽管长三角三省市的区域创新能力处于全国领先水平,也形成了各具典型特色的创新系统模式,并拥有较丰富的区域创新资源,但是,三地创新资源配置过程中,分工、共建脉络还不清晰；过度竞争现象仍然严重；信息共享程度低,重复研发的现象依然如故。整体创新协同缺乏,影响和制约着长三角创新资源的利用效率；因此,创新协同度的提升是增进区域创新效率的关键,本文选择具有典型示范意义的长三角,在大国转型经济的背景下,研究区域创新系统中的协同效应,剖析创新协同提升的内在机理,从而试图为我国区域创新的效率提升提供具有一定普适意义的思路与对策。本文所作的创新性探索要点如下：1、从区域空间视角拓展了创新协同的内涵,揭示了区域创新协同动因是协同剩余。虽然现有研究对创新协同现象关注较多,但对创新协同背后的动因研究较少。本研究发现,区域创新协同的动因是各创新行为主体预期获取的协同剩余；而各创新行为主体因追求此种经济利益有可能扭曲信息,引致系统整体协同度较低下,导致剩余减少。追求协同剩余、提升协同度的实质是各区域创新行为主体在信息不对称下通过有效的制度安排来强化互补效应与弱化冲突效应而形成的净增益的过程。2、通过协同剩余的几何模型,剖析了妨碍协同剩余的形成与增进的症结所在。研究发现,在充分信息情况下,其形成与增进可通过“分工合理+竞争适度+融合互补”三个维度的互补效应来实现。但是,因技术市场的交易所涉及三类不确定性和跨省区的政府研发决策的种种困境等引致的信息障碍,导致区域误分工,即在给定研发资源前提下,创新资源误配置,其特征是低水平的研发重复、有价值的研发投入不足等；导致区域竞争过度,内耗加剧,使得创新难以持续；导致区域融合虚置,表现为创新系统僵化和效率低下等,从而致使协同度较低,进而妨碍了协同剩余的形成。因此,弱化这种“信息障碍→研发误分工→竞争过度→融合虚置→协同度较低”的冲突效应具有紧迫性,问题的症结源于政府在区域创新协同方面存在信息障碍。3、通过对协同度实证分析,验证了上述信息障碍在地区层次上的差异。研究发现,长三角区域创新系统的整体协同度很低,而江浙沪各自的创新系统的有序度却相对较高。这一反差表明,虽然,各地政府为区域创新协同构筑了环境、设计了机制和实施了规制,使得系统在跨省区层次上初步形成,但是,这种政府主导型的、跨省区的创新系统,一方面其协同层次“重心”越高,市场配置创新资源的作用发挥越少,利益扭曲越大,信息障碍越多；另一方面各省区追求局部自身利益引致省区间利益有所扭曲,致使跨省区面临协同的信息障碍程度较大,从而导致跨省区的整体协同度较低。而对江浙沪各自而言,因协同层次“重心”低,市场作用发挥较大,利益扭曲程度较低,信息障碍较少；同时,因源自于市场在配置创新资源的作用较明显,引致政府在做出科技创新发展规划时所面临的信息障碍较少,从而导致其创新系统协同度相对较高。因此,化解信息障碍,提升协同度的关键是要构建市场治理和政府治理的互补而非替代的机制。4、从机制设计的视角,探索了化解信息障碍的有效途径。研究表明,在区域创新协同过程中,其信息障碍有特殊性,它表现一是源自于不重视市场作为创新资源配置重要手段的行政规划；二是源自于技术、知识含量较高的创新自身引起的交易费用过高。而政府惯用的规划难以化解此类信息障碍,因此,构建新型的以激励相容为特征的顺市场导向的政府动态治理机制是明智的选择。这种新型的治理机制可让市场纠偏机制由事后转变为事前,由静态转变为动态,从而降低化解信息障碍的高昂的代价,最终促使区域创新协同所致整体效率增进。