亮氨酰-tRNA合成酶和亮氨酸tRNA相互作用的分子机理

来源 :中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xuyaya
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
氨基酰-tRNA合成酶(AaRS)催化tRNA的氨基酰化反应,为蛋白质合成提供原料。合成正确的氨基酰-tRNA是蛋白质合成的质量控制的关键步骤。为了确保遗传信息被正确传递,AaRS在进化的过程中获得了多种编校机制来保证催化反应的精确性。AaRS催化反应的专一性不仅涉及到AaRS,也与tRNA有关。亮氨酰-tRNA合成酶(LeuRS)和tRNALeu的研究通常在体外实验中进行。在本研究中,我们分别敲除了酵母tRNALeu(UAG)和tRNALeu(GAG),构建了两株缺陷菌株tl(uag)-Δ1-3和tl(gag)-Δ1。我们发现酵母tRNAL。u(GAG)不是酵母生长必需的tRNA,而酵母tRNALeu(UAG)可以识别四种CUN密码子,为酵母生长必需。同时首次发现酵母用“超摆动”(superwobbling)阅读亮氨酸密码子。通过化学诱变tRNALeu(UAG)基因,我们在菌株tl(uag)-Δ1-3建立了随机突变库,在基因水平上筛选并发现了若干影响tRNALeu(UAG)转录、与LeuRS的氨基酰化和编校功能有关的关键碱基。我们还利用tl(uag)-Δ1-3通过基因定点突变得到带有修饰碱基的酵母tRNALeu(UAG)变种,进行体外tRNALeu功能研究,得到的体内和体外数据相符。该研究不仅丰富了对酵母tRNALeu功能的认识,也为进一步研究酵母tRNA的结构和功能关系提供了很好的研究系统。  氨基酰化反应的精确性依赖于AaRS对于tRNA的正确识别。tRNALeu有一个长可变茎环,属于第二类tRNA。我们实验室已经通过足迹保护(footprint)方法研究了超嗜热菌Aquifex aeolicus的亮氨酰-tRNA合成酶(AaLeuRS)对相应tRNALeu的保护位点。为了进一步研究AaLeuRS和其AatRNALeu的相互作用机理,以及同属第一类AaRS a亚类的LeuRS和ValRS对各自tRNA识别方式的异同,我们构建了一系列AatRNAVal向AatRNALeu的个性扭转突变体。我们的研究结果表明,AatRNALeu长可变茎环,D茎环和T茎环之间的协调作用对于维持AatRNALeu的三级结构,保证AaLeuRS的精确识别至关重要,而AatRNAVal和AatRNALeu三级结构的差别决定了对应的AaRS的专一性。对D茎环的精确分析表明,AatRNALeu三级结构的发挥可能更依赖D环和T环之间的氢键直接相互作用,而与D茎的关系不大,D环的大小并不直接参与酶的相互识别,而D环上的关键核苷酸氢键配对提供的作用力是三级结构形成的基础。  LeuRS一级序列的催化活性中心中,包含一个被称为连接肽1(connective peptide1,CP1)的插入序列。在形成三级结构时,CP1折叠成编校结构域。催化结构域和编校结构域通过CP发夹结构相连接。CP发夹结构由反平行的β折叠组成,具有相当的柔性。LeuRS催化功能的发挥依赖于CP发夹结构带动CP1转动一定角度,以使酶形成合适的构象。我们构建了人细胞质LeuRS(hcLeuRS)的CP发夹结构的缺失突变体,发现CP发夹结构对于氨基酸活化和氨基酰化功能的发挥至关重要,而几乎不影响酶的转移后编校功能的发挥。尽管三界生物的CP发夹结构都很保守,但只有亲缘关系较近的酵母胞质LeuRS(ycLeuRS)的CP发夹结构可以拯救hcLeuRS CP发夹结构的缺失。最后的精细定点突变结果显示,CP发夹结构上保守的氨基酸残基的柔性和电荷性质决定了酶的功能的发挥,暗示CP发夹结构一方面影响酶的折叠,另一方面直接参与酶催化反应。体内补偿实验结果和体外实验结果基本吻合。
其他文献
经济的发展促使企业间的竞争越来越激烈,企业竞争环境也更加的复杂.在新经济背景下,企业要想在竞争中保持发展,需要不断的创新管理理念,以适应经济发展的需求.企业加强人力资
本文针对企业经营管理工作中绩效考核现存的问题,提出了方向性整改措施,对改进企业绩效考核具有参考作用.
本文主要研究了OBS网络对其上的TCP业务的影响,并且提出了多个TCP流输入情况下改进OBS网络上TCP性能的方法。本论文的主要研究内容如下:首先,本文总结了OBS网络的结构特点以
无线Mesh网络(Wireless Mesh Network,WMN)是一种在移动Adhoc网络的技术基础上,开发出的一种适用于民用通信的新型宽带无线网络,具有较高的可靠性、自组织性和自愈性。目前,
从强化教育重预、防细化措施抓落实、严格监管全过程、强化排查除隐患、完善交接不断档、互检互查促安全等方面入手,树立危机意识,做实基层安全基础工作,真正筑牢企业发展的
随着我国经济的持续发展,土木工程建设在社会主义现代化建设中发挥着非常重要的作用.土木建设是一项综合性的工程建设任务,综合了设计、监理、施工等多项工程建设项目,为社会
不断发展的经济和社会,可以说给了企业更多的机遇,此种背景下,企业管理者应善于寻找机会,抓住发展良机,从各个细节入手修正企业经营管理中的不足.金融投资管理在企业经营管理
随着密集型宽带应用(如IPTV、VOD等)的迅猛发展,高速的宽带接入技术已经显得越来越重要。而如今随着无线通信技术的日益成熟,在光纤到户的方案中又多出了一项,那就是直接利用
现代人大部分时间在社会组织中度过,其职业生涯是投入时间精力最多的人生组成部分.人生发展中的物质需求和精神需求逐步提高,这些需求通过社会活动且主要是通过职业生涯才能
随着能源的消耗,我国煤炭储备量逐年下降,因此提高煤炭转化率成为了当今的热点,而洗煤技术是煤炭加工过程的关键步骤,其洗煤技术的质量将直接影响到煤炭的转化率,从而更能够