海南省文昌市铜鼓岭森林土壤嗜盐和耐盐菌多样性研究

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本研究以海南省文昌市铜鼓岭(19°40′32′′N~19°40′34.37′′N,111°00′40′′E~111°00′43′′E)为样区采集森林土壤样品,用纯培养法分离纯化样品中的嗜盐和耐盐菌;用基于16S rRNA基因序列的系统发育分析,分析样品中的嗜盐和耐盐菌多样性;用平板水解法了解菌株的胞外水解酶特性;用多相分类法(polyphasic taxonomic approach)确定潜在新类群(物种)的分类学地位;在系统发育分析数据基础上,与张家口天漠和湖南德夯嗜盐和耐盐菌类群和物种的分布特征进行初步比较分析。了解文昌市铜鼓岭森林土壤中嗜盐和耐盐菌多样性,确定代表潜在新类群的菌株的分类学地位,初步了解非盐环境中嗜盐和耐盐菌的分布特征。本研究将JMC611,MA,MH和NA这4种基础分离培养基制成含15%与20%(w/v)Na Cl的高盐平板,从铜鼓岭森林土壤样品中分离得到了213株嗜盐和耐盐细菌(含放线菌)。以菌株的表型以及部分生理生化特征去除冗余,最终得到98株代表性菌株用以后续研究。根据耐盐实验的结果,这些菌株中有94株嗜盐菌,有4株耐盐菌。基于16S rRNA基因序列的系统发育多样性分析结果表明,这98株代表菌株可归为26个物种,分属于细菌域2个门6个科的14个属。在这98个菌株中,有5株(JSM 1781026,JSM 1781065,JSM 1781072,JSM 1781083,JSM 1781138)可能分别代表了5个属的潜在新种。胞外水解酶实验结果表明,从铜鼓岭森林土壤中分离的98株嗜盐耐盐菌株中有79株菌至少有一种胞外酶活性(淀粉酶、明胶酶和酯酶),占总测试菌株的80.6%,能产1、2、3种的菌株依次为35(35.7%)、32(32.7%)和12株(12.2%)。其中产淀粉酶、明胶酶和酯酶阳性菌株依次为42株(42.9%)、62株(63.3%)和34株(34.7%)。多相分类法结果表明,菌株JSM 1781072为产芽孢、能运动、兼性厌氧的革兰氏阳性杆菌,生长在15–40℃(最适30℃)、pH 6.5–10.5(最适pH 7.5–8.0)和0–20%(w/v)Na Cl(最适5–8%)。菌株JSM 1781072的基因组DNA的G+C含量是40.3 mol%。JSM1781072的呼吸醌为甲基萘锟MK-7(menaquinone 7);极脂组成为二磷脂酰甘油(diphosphatidylglycerol),磷脂酰甘油(phosphatidylglycerol),磷脂酰乙醇胺(phosphatidylethanolamine)和1种未知的磷脂(unidentified phospholipid);菌株JSM 1781072的主要脂肪酸(>10%of the total)为iso-C15:0和anteiso-C15:0。结合系统发育分析数据、DNA-DNA相关性结果以及表型和化学分类上的数据,菌株JSM 1781072可能代表了嗜盐碱芽孢杆菌属(Alkalihalobacillus)的一个新种,建议将其命名为海南嗜盐碱芽孢杆菌(Alkalihalobacillus hainanensis sp.nov.),典型菌株是JSM 1781072(=CGMCC1.13823T=DSM 107895T)。基于系统发育分析数据结果表明,3个样区共308个代表性菌株归属于细菌域的细菌域的3个门9个科的25个属,共77个物种。从物种分布情况看,有18个广布种(polytopic species),59个特有种(sampling-zone-specific species)。广布种中,有3种在3个样区均有分布,其它15个广布种分别分布在2个样区,其中在铜鼓岭-德夯的有4种,铜鼓岭-天漠分布有3种,德夯和天漠共同分布的有8种;从属的分布来看,有12个广布属(polytopic genus),其中有7属在三个样区均有分布,其它5个广布属中,铜鼓岭-德夯共同分布2个属,天漠-德夯共同分布3个属,而铜鼓岭-天漠没有共同分布的属;从科(family)的分布看,广布科有6个(polytopic family)占优势,特有分布科(Exiguobacteriaceae)有3个。广布科中4个科在三个样区均有分布,其它2个广布科在铜鼓岭-德夯分布。天漠和德夯样区分别分布有2个和1个特有分布科,铜鼓岭没有特有分布科。根据上述研究结果所示,铜鼓岭森林土壤中的嗜盐和耐盐菌类群多样性与物种多样性较高,产三种胞外酶(淀粉酶、明胶酶和酯酶)活性菌株的比例较高,有部分潜在新类群(物种),有较高的研究价值。且通过比较分析发现,我国三个代表性非盐环境土壤中嗜盐和耐盐菌多样性都较为丰富,有一定的分布差异。
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