随着经济全球化的速度和规模不断提高，区域经济合作成为当今世界经济发展的又一个重要趋势。区域经济合作发展的动机、地域分布、组织形式及出现的一系列变化将对世界经济发展的方向与格局产生决定作用。新疆和中亚五国不仅在地理上是近邻，经济上也具有很强的互补性，相互依赖性较强，建立良好的农业合作关系，促进区域内多国经济的快速发展不仅是可能的，而且是必然的。本文首先从新疆和中亚五国农业合作的背景出发，明确阐述了新疆和中亚五国开展农业经贸合作的意义。通过对新疆与中亚五国农产品贸易状况的分析，笔者认为虽然新疆和中亚五国农产品贸易规模不断扩大、种类不断增多，但是彼此的农产品贸易商品结构较为集中，且农产品贸易额基数较小、规模不大，有待提高。接着，本文介绍了新疆与中亚五国在农业投资领域、农业科技合作领域、人才交流和劳务输出等领域的交流与合作，结合个案分析，系统阐述、分析了新疆与中亚五国开展农业合作所面临的来自国内外的诸多现实问题。然后，从地缘自然、文化、政治、经济等方面分析了新疆与中亚五国开展农业合作的基础，依据详细的统计数据，结合实证全面地分析了双方开展农业经贸合作的互补性与竞争性，并且对新疆与中亚五国的农业科技合作及互补性做了分析，通过系统深入的分析研究，笔者认为新疆与中亚五国农业合作的基础广泛、意义深远；双方农业合作的潜力巨大，虽规模不断扩大，但还处于初级阶段，仍存在一些亟待解决的问题，有待深化。本文结合中亚五国的现实国情，对比借鉴了中国与其他国家农业合作的经验，提出了三种适合新疆和中亚五国开展农业合作的模式，分别为农业技术创新联盟合作模式、企业联合合作模式、农业科技园区合作模式，并分别从优势和不足、可行性、运行模式、以及合理化建议四方面对这三种模式进行了系统的阐述。研究指出，各模式应区别对待，结合实际情况，因地制宜、灵活运用。最后，笔者就新疆和中亚五国的农业经贸合作分别从国家层面、自治区政府层面以及企业层面提出了一些实用的政策性建议。