本文以内蒙古和林格尔县公喇嘛乡为研究实体，以平原地区与丘陵地区两种农业生态系统为研究对象，采用投入产出的方法对1998～2002年两类农田生态系统的能流、物流和价值流进行了比较、分析，用功能系数法对两类农业生态系统的功能进行了分析、评价；并以劳动力、资金、土地等农业生产要素为约束条件，采用线性规划的方法，构建了两类系统农业生产结构的优化模型与调整方案。研究结果为： 1．平原地区：农田生态系统总投入能、总产出能及总产、投能之比均为增加趋势，说明系统的能效逐渐提高；农田物质循环中氮素为正平衡，磷钾素均为负平衡并在加剧；农田资金总投入与总产出及产投比均为增加趋势，说明系统的经济效益在提高。 2．丘陵地区：农田生态系统总投入能、总产出均为增加趋势，而总产投能之比为下降趋势，说明系统的能效在下降；农田氮、磷、钾素物质循环均为负平衡并在加剧；农田资金总投入在减少而总产出在增加，说明系统以牺牲环境的代价增加经济效益。 3．用功能系数法分析表明，平原与丘陵地区农业生态系统的经济、生态与社会效益功能均在显著提高，使整个系统功能增强，但前者较后者更为显著。 4．调整方案：平原地区要增加奶牛的饲养，减少肉牛的饲养；增加粮饲兼用玉米、青贮玉米和苜蓿的种植面积。丘陵地区要保证粮食作物种植面积，增加经济作物和杂粮杂豆的种植面积，适当种植饲料作物以满足养殖业需求，充分利用作物秸秆和副产品发展养羊业。