中国沿海浒苔属海藻遗传多样性的研究

来源 :中国科学院研究生院 中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gaolch010
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近年来,连续发生大规模绿潮,对沿岸生态环境造成了巨大影响。构成黄海绿潮的有害种类主要是浒苔属和石莼属的海藻。因此有必要对中国沿海的浒苔的分类、分布进行调查,并对这些浒苔的遗传多样性进行探讨。本文利用实地调查和ITS以及5SrDNA的非编码区对中国沿海浒苔属的分子分类,进化进行了研究。  采集了来自中国沿海30个位点的浒苔属的海藻,主要是缘管浒苔,扁浒苔,浒苔,肠浒苔,与前人的研究具有一致性。发现了这些海藻较多的分布在人类活动影响较大区域,如堤坝,排污口等。  基于ITS序列和5SrDNA非编码区对中国沿海浒苔的9个样本进行了研究,ITS序列基本上都是相一致的。其中ITS1序列长度为331-334bp,ITS2长度为673-681bp。浒苔的ITS序列的分歧度仅为0-0.9%,说明浒苔在ITS序列上具有高度一致性。不同地理来源的浒苔,在5SrDNA序列上存在明显的序列差异性,分歧度为0%-3.0%,5SrDNA可分为9个单倍型,两者构建的系统进化网络图无一致性。  基于ITS序列和5SrDNA非编码区对中国沿海分布的14个缘管浒苔样本进行了研究,缘管浒苔的ITS序列的分歧度仅为0%-0.9%,说明缘管浒苔在ITS序列上具有高度一致性。结合NCBI数据库中的缘管浒苔5SrDNA的序列分析,形成的26个单倍型可以分为三组,与地理分布具有一定的相关性。  采集自中国北方的扁浒苔的20个样本ITS序列分析,可以分为四个单倍型,不同的采样地共享单倍型Hap_1,不同单倍型间的分歧度为0.2%-1.1%,Hap_3可能是基本单倍型,但是涉及的样本数少。  对采集中国沿海的肠浒苔的21个样本ITS序列分析,共获得了7个单倍型,肠浒苔在厦门具有很高的多样性,具有5个单倍型,构建的系统网络图显示肠浒苔可能从厦门向南北方向扩散。  研究发现,缘管浒苔和浒苔的ITS的遗传变异小,不适合作为两者的鉴定,5SrDNA序列在浒苔和缘管浒苔之间存在较大的差异,可以作为两者的鉴定两者提供重要的分子依据。不同的浒苔ITS区遗传变异很小,不适合作为浒苔属的种下水平的分类标记,但适用于构建地理进化图。
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