巴丹吉林沙漠位于我国内蒙古自治区阿拉善高原,是我国第二大沙漠,其中分布着众多的高大沙山和湖泊群,是一座蕴藏着丰富微生物资源的天然宝库。本研究通过纯培养手段分离了巴丹湖（西）中的嗜盐菌,并利用分子生物学方法研究了巴丹吉林沙漠八个湖泊沉积物中厌氧氨氧化细菌的多样性及分布特征,为挖掘其中可培养的嗜盐菌和非培养的厌氧氨氧化菌种资源提供了理论基础和数据支持。主要内容和结论如下:（1）通过稀释平板技术,从巴丹湖（西）水样和沉积物中分离纯化,得到21株中度嗜盐杆菌,形态学特征与盐单胞菌属特征相符。通过16S rRNA序列分析表明:21株中度嗜盐杆菌均属于盐单胞菌属（Halomonas）,其中3株与泥色盐单胞菌（Halomonas lutescens Q1U）相似性最高,达到99%,另外18株与Halomonas stevensii S18214相似性最高为99%。21株嗜盐单胞菌间存在一定拮抗关系,菌株H.stevensii SS3和H.stevensii SS9的抑菌谱最广,其中可能存在可以抑制盐单胞菌属致病菌的物质。（2）通过构建厌氧氨氧化细菌16S rRNA基因克隆文库,发现在8个湖泊沉积物中均检测到厌氧氨氧化细菌的存在,但多样性水平较低,且存在一定差异。在沉积物中共发现一个已知属Candidatus Brocadia,四个潜在的新属以及个别Unknown序列。冗余分析表明沉积物中Ca²⁺、Mg²⁺、NO₃^-、Cl^-离子浓度以及盐度和含水率是造成厌氧氨氧化细菌群落结构空间差异的主要因素。（3）利用实时荧光定量PCR方法,定量分析了8个湖泊沉积物中的厌氧氨氧化细菌数量,表明巴丹湖（西）沉积物中基因丰度最低,其余7个湖泊的丰度范围在1.51×10⁴².65×10⁵ copies/g。统计分析表明各湖泊沉积物中厌氧氨氧化细菌丰度空间差异较显著,CO₃^2-、Na⁺、盐度和NH₄⁺是造成这种差异的主要因素,其中丰度与NH₄⁺正相关,与CO₃^2-、Na⁺、盐度负相关。