企业开展内部控制专项审计是建立健全企业内部控制的一种重要辅助手段,主要是通过对公司内部控制有效性实施事后评估,针对其内部管理设计和制度执行问题等方面提供改进方法,起到对企业内部控制的再控制的作用。对企业的内部控制开展专项审计虽然不能直接给企业自身带来大量利润,却可以用于全面防范本企业自身经营活动的风险、完善整个企业的内控,提升整体治理水平,从而去实现企业创造增值财富的经营目标,故开展企业内部控制专项审计是当前企业为了改善其经营及管理、提高社会经济效益提出的一大自我需要。本文系以兰州新区水务投资管理集团有限公司（以下简称“新区水务集团”）为审计研究开展对象,对内部控制专项审计相关理论进行梳理,并通过对归纳分析总结法、专家建议征询法及访谈法的运用,对集团公司开展内部控制专项审计时存在的问题进行分析,并尝试提出改进集团公司内部控制专项审计的相关建议。经过调查分析,得出结论如下:兰州新区水务管理投资集团有限公司开展内部控制专项审计时还依然出现着一些具体问题,例如,内部控制专项审计机构职能冗杂缺乏独立性,开展内部控制专项审计质量不高,开展内部控制专项审计时工作效率低,开展完内部控制专项审计后续整改情况监管不到位等问题。针对上述问题,本文给出了关于加强新区水务公司内部审计改进方案,一是要优化内部控制专项审计人员工作职责并设立总审计师职位;二是提高内部控制专项审计全过程工作质量;三是提升人员从业能力,增加审计人员储备;四是建立健全审计结果整改监管机制。本文拟通过采用以上措施改进集团内部控制专项审计,建立健全集团内部控制,助力集团高质量发展。保障以上预期效果得以实现的措施,一是加强组织领导,上下统筹形成合力;二是建立健全集团各项制度并有效推动制度落实;三是切实加强绩效考核,保障内控审计工作任务落实;四是引入内部控制专项审计工作软件,提升内控审计效率。本文研究结果对于加强新区水务集团内部控制专项审计具有较大的实践指导意义,同时对类似企业开展内部控制专项审计具有一定的借鉴作用,可以起到助力企业管理效率提升,从而实现企业相关者利益最大化。