【摘 要】
:
新型严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-Co V-2)的刺突糖蛋白(Spike蛋白)和人类ACE2之间的相互作用,导致新型冠状病毒在人体细胞的附着和侵入,是病毒进入靶细胞的关键初始步骤。本文主要采用传统分子动力学(MM MD)模拟,结合拉伸分子动力学(SMD)模拟等多种技术和方法,对新型冠状病毒
论文部分内容阅读
新型严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-Co V-2)的刺突糖蛋白(Spike蛋白)和人类ACE2之间的相互作用,导致新型冠状病毒在人体细胞的附着和侵入,是病毒进入靶细胞的关键初始步骤。本文主要采用传统分子动力学(MM MD)模拟,结合拉伸分子动力学(SMD)模拟等多种技术和方法,对新型冠状病毒的致病机制及相关抑制剂作用机制进行研究,主要内容如下:1:SARS-Co V-2的Spike蛋白,可以被宿主蛋白酶进一步切割成S1亚基和S2亚基,其中S1亚基包含与受体ACE2相互作用的受体结合域(RBD)。RBD-ACE2相互作用是介导SARS-Co V-2进入宿主细胞的关键步骤。我们使用MM MD方法,结合MM/GBSA和SMD技术,获得Spike蛋白的RBD区域与ACE2的静态结合和动态解离机制,发现影响两个蛋白质相互作用的热点残基。2:SARS-Co V-2的Spike蛋白为三聚体结构,属于I类病毒融合蛋白,在新冠病毒致病中起关键作用。该蛋白的受体结合域(RBD)有“向上”和“向下”两种构象,对应着ACE2的“可访问”和“不可访问”两种状态。当RBD张开至合适角度时,更有利于Spike蛋白与ACE2的结合。我们运用分子动力学模拟,结合MM/GBSA及SMD等技术,对Spike蛋白与ACE2的结合和解离过程进行研究,探讨RBD角度与结合作用强弱的关系,分析两种蛋白质相互作用过程中的关键残基以及它们之间形成的氢键网络,得到两个蛋白在解离过程中的构象变化,并通过丙氨酸突变进一步验证影响二者结合及解离的关键残基。3:SARS-Co V-2的Spike蛋白与ACE2结合是新型冠状病毒的致病关键原因。因此,阻断Spike蛋白与ACE2蛋白的相互作用可以在一定程度上降低致病率。相关研究发现3-[3-(三氟甲基)苯基]喹啉和利匹韦林可以直接阻止Spike蛋白与ACE2蛋白结合,左沙丁胺醇通过与Spike蛋白作用,从而阻止二者结合。我们在此基础上,通过分子对接、分子动力学模拟和MM/GBSA方法,建立三个分子抑制剂与Spike蛋白及ACE2复合物模型,并对小分子抑制剂与该复合物的结合位点、结合自由能和关键残基进行研究,获得影响抑制剂发挥作用的关键因素,为新型冠状病毒药物设计提供一定的理论依据。
其他文献
<正>一、问题的提出两位数乘两位数的内容在沪教版教材三年级下册中是这样编写的:(如图1)学生学习两位数乘两位数,是在掌握两位数乘一位数和两位数乘整十数的基础上进行的,重在探索两位数乘两位数的算法,感悟从未知到已知的转化思想。通常,教学时会先复习两位数乘一位数、两位数乘整十数等旧知,为学生学习两位数乘两位数做好铺垫;在出示例题、列出算式后,
数学是义务教育阶段的一门基础学科,如何学好数学、掌握数学、运用数学是广大教师教学教研的重点任务。相较于其他学科,推理是数学学科的核心思想之一,也是学科发展所必需的关键能力。加强小学生数学推理意识的培养,不仅能提高学生对数学知识的抽象性理解,还能使学生在逻辑推导、验证论述的过程中形成数学思维,促进认知架构的建立。基于此,文章立足小学数学传统课堂,对推理意识培养中的问题和方法展开分析。
博物馆公共艺术教育是以社会为基础的社会美术教育的分支。本文就此分支如何进行艺术普及、美育传播的实践拓展手段展开研究和比较,对英国维多利亚艾尔伯特博物馆公共教育活动案例进行分析。旨在收集西方艺术博物馆公共教育实践拓展活动的优秀案例,来提高社会群体更好地解读艺术品,理解文化和艺术学、艺术和科技的融合,建立文化自信;思考如何通过这些实践让更多的社会群体陶冶艺术情操,增加艺术知识和艺术素养;记录和梳理社会
近年来在文旅融合有关政策的推动以及文旅消费需求日益旺盛的背景下,各地积极发展文旅产业。文章通过SWOT分析得出目前开封的历史文化资源的旅游经济转化效率偏低,与开封当地的文旅基础设施建设、宋文化旅游形象营销推广不足、同类旅游城市相互竞争等因素有关,结合存在的问题提出了相应的改进建议,以期为开封宋文化旅游发展提供智力支持。
<正>如果说"亚洲价值"是对20世纪70年代以来亚洲经济复兴之路的总结,包括亚洲四小龙、四小虎和中印两大文明体振兴的趋势,那么,在2010年中国超越日本成为世界第二大经济体之后,有中国学者提出"中国价值"的话语,试图总结文明价值在中国的强大表征:60多年来中国为社会发展所孜孜以求的探索和实验的方方面面,从经济领域到新技术、新制度、新观念的落地生根、开花结果,无不经历了复杂的再创造过程,最终的成功,
学生通过归纳推理认知数学规律、形成数学概念、建构知识体系,又通过归纳推理解决问题,因此,归纳推理是小学阶段提高学生数学素质特别是培养学生创新意识的重要内容。本文结合具体的案例片段,在归纳推理的过程中,分析如何培养学生的推理意识,从而更好地进行数学教育和课程改革。
文章以“草原上的蒙古包”的教学为例,再现教师引导学生将生活实际问题抽象成数学问题进行练习、推理,形成数学应用意识的教学过程。教师围绕圆柱、圆锥表面积和容积的基础知识,使学生学会用数据论证关于圆柱侧面积和容积之间关系的猜想,用类比推理的数学思想方法,在活动中体验圆锥、圆柱外形优势,积累活动经验,促使学生在推理分析过程中,不知不觉地养成将数学知识应用于生活的意识。
<正>身处于一个科技爆炸的时代,几乎每天都有新的事物产生,但在所有预期的未来科技中,最受瞩目的无疑就是可控核聚变了。为什么人类对于可控核聚变的关注度如此之高呢?因为这是一个不同于其他技术的变革性技术,它的成功将会彻底改变我们的生活方式,将会使人类文明迈入一个新的发展阶段。能源是文明发展的基础,文明越是进步,对于能源的需求就越大,如果能源的获取方式得不到改变,文明也就很难继续向前发展。就拿现在人类所
景观格局的变化影响着区域生态安全及可持续发展,研究干旱区城市景观格局时空变化特征,对干旱区景观格局优化具有一定的指导意义。基于1987、1995、2000、2006、2011和2016年6期土地利用数据,利用景观格局指数计算方法,研究张掖市景观格局的时空演变特征。结果表明:(1)2016年张掖市景观类型主要为未利用地,最大斑块指数和斑块聚集度最高,草地和耕地次之,草地的斑块个数和密度最大。(2)张