本研究选取福建省10个国家级动物疫情测报站及厦门市同安区、莆田市荔城区和南平市延平区共13个县(市、区)作为本次调查点。每个调查点选择规模养猪场、生猪屠宰场和生猪散养户进行弓形虫、猪蛔虫、结节虫、猪类圆线虫、鞭虫,球虫、结肠小袋纤毛虫等寄生虫病现场调查和抽样检测,收集临床发现的寄生虫标本。本研究对1087份样品进行了猪胃肠道寄生虫调查,其中检出猪蛔虫阳性49份,阳性率为4.51%;猪结节虫阳性13份,阳性率为1.19%;猪类圆线虫阳性29份,阳性率为2.67%;猪鞭虫阳性17份,阳性率为1.56%;猪球虫阳性209份,阳性率为19.23%;猪结肠小袋纤毛虫阳性341份,阳性率为31.37%。本研究对2952份样品进行了猪弓形虫调查,抗体阳性545份,阳性率为18.46%。地域分布中,阳性率最高的是龙岩市,阳性率为24.30%。最低的是三明市,阳性率为13.03%。养殖类型分布中,规模场阳性率最高,为24.43%,散养户阳性率为18.40%,屠宰场阳性率最低,为7.11%。时间分布中,第三季度阳性率最高,为44.37%,第四季度阳性率最低,为10.22%。本研究根据Genbank上的Isospora suis 18SrRNA基因全序列(U97523)设计1对特异性引物,建立猪等孢球虫病的PCR诊断方法并进行了敏感性和特异性实验。结果证明此方法可以快速诊断猪等孢球虫的感染,缩短了孢子化的时间,极大的提高了检测效率。