番茄SlPIN家族基因在干旱和盐胁迫下的应答网络分析及重要家族成员功能验证

来源 :东北农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jayleardutt
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
番茄起源于秘鲁、厄瓜多尔、玻利维亚等地的安第斯山地带。最初作为观赏植物栽培,后继传入世界各地并在18世纪中叶开始作为食用作物栽培。番茄具有丰富的营养价值,其中番茄红素具有独特的抗氧化能力,现在番茄已经成为人们生活中不可或缺的一种蔬菜。但是在番茄生长过程中,逆境环境(干旱、洪涝和土壤盐渍化等)的出现会导致番茄产量和品质的大幅降低,严重制约农业经济的发展。植物生长素在植物整个生长发育过程中都发挥着重要的作用,包括促进细胞的生长和分化、顶端优势、向重力性和促进果实的发育。生长素的作用与其浓度和分布有着密切的联系,而其分布取决于生长素的极性运输。番茄PIN蛋白家族是一种公认的生长素输出载体,在一定条件下可对生长素的极性运输产生调控作用。研究显示逆境环境胁迫可以造成生长素极性运输的应激反应,改变PINs蛋白的下游调节,进而影响植物的抗逆特性。在团队前期的研究中,发现番茄多个PIN家族成员对包括干旱和高盐逆境胁迫应答显著,且Sl PIN1的沉默降低了番茄植株的抗旱性,说明该家族成员与植物抗旱和抗盐胁迫应答密切相关,为了进一步明确该家族基因在两种逆境下的应答机制及筛选出具有抗逆调节能力的家族成员,本研究将以前期番茄抗旱和抗盐胁迫应答转录组数据为基础,对番茄Sl PIN家族进行抗逆应答调控网络分析,同时对部分家族成员进行抗旱和耐盐功能研究,为番茄抗旱和耐盐机理研究以及抗逆育种实践奠定基础。主要研究结果如下:1.以番茄干旱和盐胁迫应答转录组数据为基础,进行生物信息学分析,GO分析发现Sl PIN家族成员主要参与细胞膜相关及生长素运输相关功能,但KEGG未能富集到某一条通路上。2.在转录组数据中对Sl PIN家族成员互作关联基因进行调取,获得146个关联基因,GO分析显示这些基因除参与生长素运输外,还与离子交换、DNA结合以及MAPK磷酸化等功能相关,KEGG分析则主要富集在植物激素信号转导途径以及氮代谢通路等。3.通过对146个关联基因进行互作网络分析,获得4个互作复合体模块,进一步筛选获得了9个具有10个互作因子以上的重要关联基因,这些基因均集中在生长素信号通路。4.对最终筛选出的5个重要关联基因,采用荧光定量PCR方法,进行干旱胁迫和盐胁迫下表达模式验证,结果与转录组数据吻合。5.通过外源ABA诱导,发现几乎所有成员都发生了迅速上调表达,其中Sl PIN3上调后下降较慢,受ABA影响时间最长。6.分别对Sl PIN3、Sl PIN6和Sl PIN7进行了VIGS基因沉默,结果发现3个基因沉默后的植株均出现了抗旱能力下降,Sl PIN3和Sl PIN6基因沉默可导致植株耐盐能力下降,Sl PIN7沉默对植株耐盐性影响较小。
其他文献
目的:本实验旨在观察HCN(hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channels,HCN)通道在小鼠海马神经元HT22细胞系氧糖剥夺再灌注(oxygen glucose deprivation/
基于视频的渔船驾驶舱人员检测是渔船安全行驶的保障。为解决渔船驾驶室小范围场景下人员的多姿态、多尺度、遮挡严重造成的检测精度不高的问题,系统针对场景重新建模,优化各组件权重和改变可变形部件模型的打分函数,并优化非极大抑制法,进一步缓解人员遮挡造成的多检和漏检问题,最后利用北斗卫星导航系统的报文传输功能实现对近海渔船的驾驶舱安全监控。实验结果表明,系统进一步增加了该场景下人员检测和人数统计的精度,满足
针对钢结构工程作业进度的监管效率低下与可视化程度不高的问题,分析国内外有关工程进度可视化监管的研究现状,指出当前类似的可视化监管操作复杂、不够直观简洁的缺陷。为此,提出一种快速简便的可视化监管方案,将工程现场的统计数据转化为进度模型并通过网络实现远程交互。在C#编程环境下引入工程管理平台与钢结构设计软件开发可视化监管系统,重点研究基于Tekla Structures的开发及基于K-最近邻算法的应用
针对加强的长期演进LTE-A(Long Term Evolution-Advanced)网络下机器对机器M2M(Machine-to-Machine)通信上行链路的能量效率问题,提出一种基于LTE-A网络中M2M通信上行链路调度的资源分配算法。构建系统模型与定义最大能量效率目标函数;通过对原系统模型重构将具有非线性约束条件能量效率最优问题化解为二维背包问题;采用Charnes-Cooper变换和G
目的观察Z型肌肉注射法结合留置气泡技术在老年患者中的应用效果。方法选择接受肌肉注射的老年患者80例,采用自身对照法,对每例患者分别在左、右两侧臀大肌进行常规注射法和Z
振动筛是颗粒分级工作中应用最为广泛的筛分机械。根据振动轨迹的不同,振动筛主要可分为三大类:直线振动筛、椭圆振动筛与圆振动筛。诸多研究人员认为,椭圆振动筛兼具了直线
背景:缺血性脑卒中目前是导致全球成人残疾最主要的原因之一,目前主要的治疗方法是超急性期溶栓,预后大多不理想。因此,有效的治疗脑卒中,促进脑卒中后的组织修复和功能重建具有重要意义。人脐静脉内皮细胞对受损的神经元具有保护作用,能够抑制受损神经元的凋亡,促进神经干细胞的增殖与分化。但是,关于人脐静脉内皮细胞来源的外泌体在促进脑卒中后血管新生、神经元再生及突触重塑方面的研究较少。目的:评价人脐静脉内皮细胞
目的:通过观察电项针治疗急性低频感音神经性聋(acute low-tone sensorineural hearing loss,ALHL)的临床疗效,为临床治疗本病提供更多思路。方法:本研究选取符合纳入标准的8
通过尾矿库安全检测的自动化优势来实现对尾矿库未来发展方向的准确掌握控制,为具体工作开展提供切实可行的参考依据。本文在此以GPRS技术为研究重点,借助系统框架总体设计实
<正>为进一步落实科学发展观、引导城市建设健康发展,建设部于今年三月二十五日下发新修订的《国家园林城市申报与评审办法》及《国家园林城市标准》内容如下:
会议