基于16S rDNA水平的海洋厌氧活性菌株的分类学研究

来源 :大连交通大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:lovezx1990
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海洋厌氧活性菌株分类学的研究,不仅有助于探索海洋环境中药用厌氧菌的资源,扩大新物种的种类和数量,而且是海洋厌氧菌抗生素研究的前提和必要条件。海洋中微生物多种多样,由于生活环境的多样性,如光照、氧气、压力等多方面因素有着巨大的差异,海洋菌群的形态结构和生理功能具有许多特性。其中80%左右为厌氧微生物,如光合细菌、硫酸盐还原细菌、反硝化细菌、产甲烷菌等等。它们参与新陈代谢的酶系与海洋好氧微生物有显著差异。不同的代谢、呼吸过程产生的次生代谢产物理论上也会有较大的差别,新型的代谢过程往往可能产生新型的次生代谢产物。因此海洋厌氧微生物的分类学研究对新抗生素的筛选及新药的开发具有重要的意义。 本研究从大连黑石礁和长海县附近海域采集了33个样品,包括黑石礁的1瓶水样和2瓶混合泥样;长海县的30瓶底泥,并最终从样品中分离到69株海洋纯菌株,其中29株为有抗菌活性的海洋厌氧菌:海洋光合细菌9株,海洋反硝化细菌16株,海洋锰氧化菌4株。对其中5株有代表性的细菌进行了鉴定。分类特征的研究结果显示,5株活性海洋厌氧细菌的形念特征差异显著。海洋菌株DN7、DN5、DN3-2鉴定结果为施氏假单胞菌,对枯草芽胞杆菌和铜绿假单胞菌有明显的抑制作用;鉴定菌株PSB07-1为微小杆菌;海洋细菌DN3-1的16S rDNA序列和GenBank中的序列比对发现最高相似度为97%,通过形态学及生理生化实验鉴定为交替单胞菌属的一个新种(Alteromonas),暂定为耐盐交替单胞菌。
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