动物界存在广泛的性别二态性现象。性别二态性指同一物种的雄性和雌性之间除生殖器官外的表型差异,相应的特征通常被称为第二性征。对性二态的进化机制的研究有助于深入理解自然种群的遗传分化及物种形成机制等进化生物学问题。对于性二态的研究,常规的方法通常是对动物开展长期的野外调查,进而推论出性二态可能的生物学意义,而蝙蝠的飞翔、夜行等特点加大了开展常规研究的难度,这也导致在蝙蝠的性二态研究领域,常常局限于现象本身的描述,却很少有较深入的研究。蹄蝠科普氏蹄蝠（Hipposideros pratti）的第二性征鼻叶表现出明显的性别二态性,成年雄性的鼻叶上的肉质盾片明显大于雌性,但导致这种差异的具体机制尚不明确。本研究以普氏蹄蝠为研究对象,采用转录组学方法,分析了不同表型的雄性蝙蝠在基因表达水平和基因型上的差异,期望能阐明形成普氏蹄蝠第二性征形成的遗传学基础及背后可能的进化机制。通过de novo组装方法及后续的去冗余等过滤后,我们共保留了10,652个转录本数据。加权的基因共表达网络分析（WGCNA）将这些基因划分为11个共表达模块,其中有2个模块与盾片大小显示显著的相关性。后续的功能富集分析显示有多个功能类别在大盾片个体中高表达,包括雄性激素受体调控、DNA损伤应答、免疫细胞分化、神经活动、学习记忆、感官刺激感知等,提示大盾片雄性在攻击性、性行为频率、身体健康程度及对环境的适应性等方面优于小盾片个体。由于性二态的进化的驱动力主要包括生态学因素和性选择,考虑到二者作用的器官类型的不同,我们推测盾片形态的变异更可能是性选择的结果。SNP鉴定与分析中,共鉴定得到157,327个高质量的SNP,其中筛选到261个与盾片性状相关的候选位点。这些位点多位于基因非编码区或基因间区,涉及的功能有DNA修复相关的转录调控、神经系统发育调节、脂质代谢调控、激素释放的调节等,其结果与基于基因表达水平的基因关联分析富集到的通路相关,表明个体间基因表达水平的变化可能受到基因型水平变异的调控,初步揭示了盾片的形态变异的遗传学基础。综上,本研究从分子水平提供了对普氏蹄蝠盾片的第二性征的遗传学基础和进化机制的可能解释,为今后进一步开展普氏蹄蝠性别二态性研究提供了参考,也为哺乳动物的性选择理论的进一步完善提供了借鉴。