新疆维吾尔族宫颈癌基因组表达谱的差异及聚类分析

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目的:宫颈癌是女性最常见的恶性肿瘤之一。宫颈癌是世界女性第二大恶性疾病,在我国居女性恶性胜瘤之首,它的高死亡率严重地威胁着女性的生命健康。据统计全球每年约50万妇女被诊断为宫颈癌,25万死于宫颈癌。子宫颈癌亦是新疆高发肿瘤之一,有关子宫颈癌的研究一直是新疆妇科肿瘤工作者关注的热点之一。人乳头瘤病毒(HPV)高危型如HPV16、HPV18的感染是导致宫颈癌的主要原因,但病毒最终通过细胞中基因表达引起蛋白异常而致病,因此,确定宫颈癌的相关基因,从生物分子水平上了解细胞癌变的机制,为宫颈癌的临床诊断、预防、预测及治疗提供分子标记及靶基因。利用Oligo芯片了解新疆维吾尔族宫颈癌患者基因表达谱的改变,探索新疆维吾尔族宫颈癌差异表达基因与其生物学特性的内在联系和规律。方法:收集我院2006年12月—2007年5月手术切除的南疆维吾尔族妇女宫颈鳞状细胞癌标本7例,非宫颈病变的宫颈手术标本4例。用Trizol一步法抽提标本总RNA,在反转录合成cDNA探针的同时以Cy3和Cy5分别标记11例标本和Universal HunmanReference RNA sample,将Cy3和Cy5标记探针混合后与含有21522个基因的人表达谱芯片杂交。经洗片、扫描、软件处理后,分析子宫颈癌和正常子宫颈标本之间基因表达谱的差异,并对差异表达基因进行聚类分析。结果:宫颈癌组与正常宫颈组相比,差异表达变化2倍以上的基因共有1159条,差异表达变化3倍以上的基因共有378条,本文主要讨论差异4倍以上的显著差异表达的基因有212条,其中166条上调,46条下调。212条差异表达基因通过数据聚类分析,发现类内部的个体在特征上具有相似性,不同类间个体特征的差异性较大。结论:寻找到了极少部分南疆维吾尔族妇女宫颈鳞癌差异表达基因,在一定程度上可预测基因差异变化与生物学行为的关系。
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