肌少—骨质疏松症与单纯骨质疏松症患者microRNAs差异表达谱分析

来源 :福建医科大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:jhson47
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目的:探讨肌少-骨质疏松症(sarco-osteoporosis,SO)与单纯骨质疏松症(osteoporosis,OP)患者mi RNA的差异表达谱。方法:收集肌少-骨质疏松症与单纯骨质疏松症患者的肌肉组织,采用Illumina Hiseq 2500高通量测序技术分析和鉴定两组(每组3重复)样本之间差异表达的mi RNAs,然后采用q RT-PCR技术验证mi RNAs测序结果的可靠性,并对已经通过验证的4个差异表达mi RNA(hsa-mi R-381-3p,hsa-mi R-29b-3p,hsa-mi R-433-3p,hsa-mi R-182-5p)进行靶基因预测和基因本体论(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析。结果:与单纯OP组相比,SO组中共鉴定212个差异表达的mi RNAs,筛选出其中差异表达显著的34个mi RNAs(︱log2(fold-change)︱≥2且P<0.05),包括22种在SO患者中表达上调的mi RNAs和12种表达下调的mi RNAs。q RT-PCR的结果表明测序结果是可靠的。GO分析结果显示靶基因富集于免疫反应、受体和蛋白质结合、代谢等生物过程。KEGG通路分析显示,差异表达mi RNAs的靶基因显著富集于破骨细胞分化、细胞因子受体相互作用、NF-κB信号通路、Notch信号通路等。结论:我们的研究发现肌少-骨质疏松症与单纯骨质疏松症患者存在34个差异表达显著的mi RNAs,这些差异表达的mi RNAs中,其中hsa-mi R-381-3p、hsa-mi R-29b-3p、hsa-mi R-433-3p、hsa-mi R-182-5p等为我们后续深入研究肌肉减少症患者易发生骨量丢失的病理生理过程提供了有价值的线索。然而,需要后续深入地对筛选出的mi RNAs及其靶基因进行挖掘和验证,以期为临床上增龄性肌骨相关性疾病的防治提供理论基础。
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