Sam68调控NF1外显子23a可变剪接的初步研究

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Pre-mRNA剪接是指剪接体正确识别、连接短外显子并精确去除长内含子,从而转录成熟mRNA的过程。可变剪接是指从一个mRNA前体通常可以通过不同的剪接方式产生不同的mRNA剪接异构体。可变剪接是生物功能复杂性和蛋白质组多样性的重要原因,其错误调控会引起细胞组织特异性分化、发育的异常乃至疾病的发生。I型神经纤维瘤病(NF1)是一种常见的常染色体显性遗传病,该疾病的发病率为1/3500。NF1基因可变剪接通常发生在外显子9a/9br,10a-2,23a和48a区域。外显子23a位于神经纤维瘤素蛋白GRD酶活性功能域中,可调控Ras活性。Sam68(SRC associated in mitosis of68 kD)是集信号转导特性与RNA激活功能于一身的RNA结合蛋白,参与转录、信号转导、细胞周期调控、可变剪接及核输出等过程。已证明Sam68通过识别靶基因外显子/内含子邻近富含AU的序列而参与调控可变剪接。而NF1基因可变外显子23a侧翼序列富含AU序列如(UAAA或UUUA)。到目前为止,还未有关于Sam68调控NF1的相关报道。本论文在构建了NF1及突变体微基因及Sam68重组质粒的基础上,将NF1微基因及突变体微基因及过表达Sam68重组质粒共转染HeLa细胞,并通过Cy3荧光标记半定量RT-PCR体系检测Sam68是否调控NF1外显子23a的可变剪接。此研究对后续研究Sam68调控NF1可变剪接的分子机制及进一步为I型神经纤维瘤病疾病的发生、发展及治疗具有一定的指导意义。具体内容如下:  1、Sam68重组质粒的构建及表达:从293T细胞提取总RNA,反转录cDNA,通过特异性引物扩增Sam68目的片段,进而构建出Sam68重组质粒,并将Sam68重组质粒转染到HeLa细胞内,用G418进行稳定细胞株的筛选。为后续研究Sam68剪接因子是否调控NF1基因及Sam68剪接因子调控NF1基因机制奠定基础。  2、建立Cy3荧光标记半定量RT-PCR体系:以Cy3荧光标记NF1可变外显子23的上游引物,利用半定量RT-PCR技术确定NF1外显子23a的保留率。并在此基础上探讨了RT-PCR扩增循环数和起始模板量对Cy3荧光标记半定量RT-PCR分析结果的影响,进而确定其最佳的扩增条件。  3、构建NF1微基因及突变体微基因:从人类外周血中提取人类全基因组DNA,利用PCR方法扩增目的片段并导入pEGFP质粒载体中,从而构建了分别包含NF1微基因及突变体微基因。用酶切及菌落 PCR将构建的NF1微基因及NF1突变体微基因进行鉴定,将鉴定正确的NF1微基因及NF1突变体微基因分别命名为pEGFP-NF1和pEGFP-NF1m,为后续pEGFP-NF1及pEGFP-NF1m表达奠定基础。
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