基于逆转录环介导等温扩增技术的高灵敏度HIV-1 RNA检测

被引量 : 0次 | 上传用户:zhouhai3032
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
艾滋病是一种致死性传染病,由人类免疫缺陷病毒HIV引起,该病毒分为HIV-1和HIV-2两型,前者是导致艾滋病的主要原因。中国是目前世界上艾滋病疫情发展较快的国家之一,且目前世界上没有可有效预防该疾病的疫苗和治愈艾滋病的特效药物。因此,HIV的检测成为控制和预防艾滋病的关键环节,是尽早发现HIV感染者、掌握疫情和病程、指导抗病毒治疗和疗效判定的有效手段。我们需要一种检测方法,它既有很高的敏感性、特异性,又要缩短窗口期、操作简便、快速和经济,从而增加检测可及性,能在现场检测即时出结果,以提升目前的检测水平和扩大应用范围。本论文利用一种新型、快速的核酸检测方法——逆转录环介导等温扩增技术建立了基于HNB颜色判定的RT-LAMP高灵敏度定性检测HIV-1RNA体系和基于RT-LAMP的快速定量HIV-1RNA体系。针对HIV-1gag保守基因设计RT-LAMP引物,使之能特异高效的检测出病毒基因。在RT-LAMP定性检测中,本研究将HNB与RT-LAMP技术结合,使得反应结果可通过肉眼直接观测,脱离了对仪器的依赖,对该方法的灵敏度、特异性及临床样本检测等一系列性能进行了评估。在病毒载量定量实验中,本实验将RT-LAMP与HIV-1RNA的定量相结合,考察了该方法的定量性能(包括标准曲线的建立、最低检测限、实验再现性、特异性等),并通过与qRT-PCR对临床样本检测能力的一致性分析,评估了本方法在临床应用上的可行性。本研究结果表明,利用可视化的RT-LAMP体系检测HIV-1RNA,其引物灵敏度可达到5copies RNA,与其他血源性、同致病机制病毒(HTLV-1、HIV-2和HCV)无交叉反应,引物特异性良好;加入HNB的RT-LAMP体系能够正确的反映扩增的阴阳性,与琼脂糖凝胶电泳及实时浊度监测结果一致,且120μM的HNB不会降低引物的灵敏度;通过对95份临床样本分别进行RT-LAMP和qRT-PCR发现,该RT-LAMP体系的敏感性为95.29%,特异性为100%,假阳性率为0%,假阴性率为4.71%,功效率为95.79%,阳性预示值为100%,阴性预示值为71.43%,通过Kappa检验得知Kappa值=0.810,说明两种检测方法的一致性较好。利用RT-LAMP进行HIV-1RNA定量检测时发现,该方法的定量范围为2.5×102~1.0×107copies RNA,R2为0.991,最低检测限为196copies RNA,实验再现性良好,特异性为100%;对42份临床样本进行RT-LAMP定量和qRT-PCR,对其结果进行Bland-Altman分析,发现两种定量方法一致性为95.24%,p值<0.05,说明方法间一致性良好。通过本论文的研究证明,RT-LAMP是一种快速、高效的HIV-1核酸现场检测手段,同时又具备HIV-1RNA的定量性能,有助于提高我国HIV检测技术水平,从而有效控制HIV的传播,辅助艾滋病病程监测与临床用药指导,具有极其广阔的应用前景。
其他文献
笔者临证多年来,自拟加味导赤散治疗此病,疗效满意,现报道如下。临床资料50例均为本院2005~2008年门诊的2型糖尿病伴泌尿系感染的患者,空腹血糖在5~13mmol/L,伴肾功能不全20例,
近年来,伴随着经济全球化的不断深入,供应链管理作为一种新的管理模式应运而生并且几乎在所有的行业中普及。由于担保系统不健全、金融机构与企业之间的信息不对称、融资中小企
探讨微创食管癌切除术(MIE)联合辅助性化疗对局部晚期食管癌患者的治疗效果。选取郑州大学附属郑州中心医院2013年2月—2015年6月收治的200例局部晚期食管癌患者,根据患者意
国家机关工作人员的渎职犯罪违背了公务职责的公正性、廉洁型和勤勉性,具有巨大的社会危害,是各国刑法规制的对象。"损失结果"的司法认定对于渎职犯罪的查处具有重要的意义,
随着微博的发展,“微博问政”出现并改变着政民关系。"微博问政"是公众与政府利用微博探讨及推动各种公共问题解决的动态过程,是常规问政形式的补充。"微博问政”的发展,可能对
住宅体验区也称之为样板房区或者住宅示范区,随着中国房地产的迅速发展,逐渐成为售楼处营销活动的一个重要的组成部分。它是在项目中选取合适位置和有代表性户型,并以此为中心规
本文以五步拳为研究对象,运用文献资料法和逻辑分析法对五步拳在中小学武术教学中的优势和价值进行研究。结果表明,五步拳在中小学武术教学中有突出的优势和价值。该研究对少
目的:分析妊娠期糖尿病孕妇并发子痫前期的相关因素及对孕妇和新生儿的不良影响。方法:选择50例妊娠期糖尿病孕妇为对照组,50例妊娠合并糖尿病同时并发子痫前期孕妇为观察组,对
对香港、北京、上海、广州、福州、苏州的部分中学体育教师关于 2 1世纪体育教师应具备的能力的问卷调查和统计分析显示 ,香港与内地中学体育教师相当一致地认为 ,教学能力、
证人特权制度作为一个价值衡量问题,凸显了在发现案件真实来源之外所应保护的其他社会利益及价值。文章重点探讨证人特权制度免证权适用中免证主体与免证事项两个问题,同时就