南方四省树生斑痣盘菌科分类与该科基于ITS和28SrDNA序列系统发育学

来源 :安徽农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:shanlai_lu
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本文由两部分研究内容构成。第一部分是以Darker(1967)分类系统原则为分类基础,对我国江西、四川、海南和台湾四省一些树生斑痣盘菌科( Rhytsmataceae Chevall.)菌物从形态结构、个体发育、生境及生态等方面进行分类学的系统研究。第二部分以现代分子生物学技术基础,获取相关DNA基因组,分别构建以ITS和28S rDNA序列以及两者联合序列为基础的系统发育树;得到该科供试菌株的ITS序列总长及A、T、C、G和G+C含量;结合生物信息学对该科属间、种间及种内的亲缘关系进行探讨。具体内容如下:  1.对实地采集、邮寄所得等保藏在安徽农业大学森林菌物标本室(AAUF)的南方四省斑痣盘菌科材料进行整理与鉴定,选取部分标本对其进行以形态学为主的分类研究,确定了齿裂菌属(Coccomyces)、散斑壳属(Lophodermium)、斑痣盘菌属(Rhytisma)、小沟盘菌属(Lirula)和特里尔盘菌属(Terriera)5属中12个种。其中包括新种4个:台中齿裂菌(Coccomyces taizhongensis)、四孢散斑壳(Lophodermium quadrisporum)、五指山散斑壳(L. wuzhishanense)和山橿枝特里尔盘菌(Terriera linderae);中国已知种8个,分别为贝壳杉散斑壳(L. agathidis)、针叶树散斑壳(L. conigenum)、佩特拉克散斑壳(L. petrakii)、冷杉散斑壳(L. picea)、乔松散斑壳(L. pini-excelsae)、点斑痣盘菌(R. punctatum)和柳斑痣盘菌(R. Salicinum)。对新种提供了形态特征、讨论、寄主、生境的描述及记载和点线合成图和(或)宏、微观照片;对其余中国已知种进行了一些补充性研究,附简要的形态特征描述和讨论。编制了南方四省斑痣盘菌科真菌的分种检索表。  2.对国内部分斑痣盘菌科成员进行系统发育学研究。利用CTAB法对供试菌株的相关DNA组进行提取,再通过PCR扩增、纯化和测序,选取合适的序列(ITS序列、28Sr DNA序列及ITS+28S rDNA联合序列),构建以柔膜菌目中的Leotiia lubrica为外群的三个系统发育树,即ITS rDNA序列系统树、28S r DNA序列系统树及ITS+28S rDNA联合序列系统树;结合形态学分类方法,确定该科真菌的分类地位。通过系统发育树分析,得出以下结论:在斑痣盘菌科中,优先聚在一起的通常为同一属内的种、同一种的不同菌株,并且具有较高的自举值,从而验证了利用形态分类技术对斑痣盘菌科成员进行的分类具有重要的意义和很高的参考价值;菌株的生态环境与地理位置等对于该科的种间或种内亲缘关系具有一定的影响;寄主与该科内亲缘关系存在很大的相关性;有些外型相似的不同属、种也有可能聚在一起。研究过程中仍存在一些不足,发现仅依靠单基因、双基因或者联合基因序列的分析是不够的,需采用更多的基因序列完善现代分子生物学为基础的菌物分类研究。  我们认为,菌物系统发育学的研究不能仅仅依靠某种单一的方法,需要采用多性状综合分类技术对真菌的形态学、发育学、遗传学、生理生化、获养方式以及分子生物学等特征进行全面、系统的综合分析,以获得更加自然、合理与科学的研究结果。
其他文献
为筛选具有烟草亲和性的解钾PGPR(Plant Growth-Promoting Rhizobacteria)菌株,考察PGPR对烟草生长和叶片钾含量的促进作用,为烟草专用生物钾肥的研发提供试验材料和理论依据。
本论文建立了2,4-二硝基氟苯柱前衍生高效液相色谱法直接检测β-丙氨酸与L-天(门)冬氨酸的新方法。该方法色谱条件为:色谱柱为Zorbax SB C18柱(5μm,4.6~*250mm);流动相A为0.02mol/LNaAc-HAc缓冲液,pH6.2,流动相B为乙腈,采用线性梯度洗脱:时间(min)0→20,流动相B(体积百分含量,%)5→33;流速为1.0mL/min;柱温为30℃;检测器为紫外
稻瘟病菌(Magnaporthe grisea)是重要的植物病原真菌,也是研究丝状真菌的重要模式生物。稻瘟病菌丝氨酸蛋白酶可能作为稻瘟病菌分泌到细胞外与寄主受体蛋白起作用的激发子之一。
学位
塑料工业高速发展带来的环境污染和石油资源短缺问题日益严重。因此,研究和开发环境友好型生物可降解材料受到广泛关注和重视。淀粉具有来源广泛、价格低廉、可生物降解等优点
钼是植物生长发育过程中必不可少的微量元素,其生理作用主要是通过一些含钼酶来实现的,尤其是对豆科植物的固氮和根瘤的形成具有重大的影响。百脉根(Lotus japonicus)是豆科百脉
有关退化植被恢复过程与环境的协同变化关系是演替研究的难点。本文以南方喀斯特石漠化地区(花江)不同恢复阶段的植被为研究对象,采用“以空间系列代替时间系列”方法选择样地
吗啡是临床常用的一种阿片类镇痛药,被广泛用于治疗各种急慢性疼痛,但是,长期使用会产生药物耐受,并具有成瘾性,使其应用受到很大的限制。   近年,MAPKs(mitogen-activated prot
疫病是辣椒生产上的一种毁灭性病害,辣椒抗疫霉生理生化基础研究对于栽培上辣椒疫病的控制以及辣椒抗疫病的遗传改良均具有重要的指导意义。本试验以具有不同疫霉菌抗性的辣
本课题源于国家自然科学基金(30871444),安徽自然科学基金(11040606M71),安徽教育厅重点(KJ2008A139),国家973计划(2010CB126206),对合肥地区2013年、2014年黄山大叶种(黄山