随着科学知识的不断累积，科学研究越来越趋向于团队合作，通过科研合作，不仅能够促进知识创新，提高科研生产力，还能降低成本，改善科研组织结构等。科研合作最直观、最主要的表现形式为论文合著。如何通过对论文合著网络的分析，来研究科研合作情况，促进科研工作者之间的合作与交流，成为近几年研究的热点。教育部重点实验室是国家科技创新体系的重要组成部分，在学科建设、人才培养、社会服务等方面发挥着越来越重要的作用，因此加强此类科研机构的研究和建设具有重要意义。　　本文运用社会网络分析的理论和方法，以某大学两个教育部重点实验室为例，搜集了各自从2000年至2014年的论文合著数据，利用分析工具UCINET和Netdraw建立合著关系网络模型，统计了论文总数、合著论文数、合著程度、合著规模、合著模式等科研合著基本情况，计算了网络密度、凝聚子群、聚类系数、平均路径长度、度分布、中心性等反映网络整体属性和网络个体属性的指标，并对以上统计结果进行了对比研究，以及对小世界特征和无标度特性进行了判断。同时探讨了两个实验室科研合著网络的动态演化过程和特点。　　通过研究，发现两个教育部重点实验室合著程度高，机构间合著为主；合著网络具有小世界特征和无标度特性；合著网络中核心成员地位明显；Z实验室比H实验室低产且合著网络整体规模较小；科研合著规模偏小；合著网络密度偏低且具有多核结构；合著网络“边缘”成员数量众多；Z实验室人才梯队建设有待加强；两个实验室科研合著演化情况良好。并在此基础上提出了改善教育部重点实验室科研合作情况的若干建议，对于完善科研合作结构和把握未来发展方向具有借鉴意义。