云南省香格里拉县子尼铜矿地处甘孜—理塘结合带西侧，金沙江缝合带以东的印支期义敦—中旬岛弧带南段及中甸弧后盆地南段。　　云南省香格里拉县子尼铜矿赋存于三叠系上统哈工组三段(T3ha3)地层中，属中低温热液铜矿床。矿体主要由铜矿（化）体、粉砂质板岩、含砾粉砂质板岩等组成，其上下部多为粉砂质板岩。矿体总体形态多种多样，以似层状、透镜状、分枝的脉状为主，其次为不规则透镜状、囊状、树枝状，常具分枝复合，尖灭再现、尖灭侧现等特征。矿体品位Cu0.29～1.09％，平均品位Cu0.72％。　　矿石中的非金属氧化物造岩组分主要为SiO2、CaO、Al2O3、MgO，硫化矿的造岩组分与氧化矿一致，SiO2、CaO、Al2O3含量高于氧化矿。矿石的造岩组分与矿石类型、蚀变矿物相吻合。　　本矿区之铜矿石，可划分为氧化矿石和硫化矿石。氧化矿石中铜元素主要赋存于孔雀石(Cu2CO3(OH)2)、蓝铜矿(Cu3(CO3)2(OH)2)中，硫化矿石中的铜主要以独立矿物的形式赋存在黄铜矿中，少数赋存在斑铜矿中，黄铜矿呈浸染-稠密状于矿石裂隙中，与脉石矿物不规则毗连镶嵌，少数包于黄铁矿、磁黄铁矿、毒砂中，脉石矿物为长石、菱铁矿、石英及金属矿物黄铁矿。　　子尼铜矿床属于中低温热液受构造控制的铜矿床。子尼铜矿的各个矿化体及各个矿体均严格受到南北向的断层及其相应破碎带控制，矿体展布特征都是沿破碎带展布且分布在破碎带顶板，由此可推断子尼铜矿床的成因与沿格咱深大断裂中上升的深部岩浆热液密切相关。矿体的围岩蚀变多以碳酸盐岩化、绢云母化、绿泥石化及硅化等为主，这都是典型的中—低温热液蚀变，所以子尼铜矿的成矿热液应为中-低温性质。