卤虫(甲壳纲无甲目)是一种广温耐高盐生物，因此其分布极广，遍布世界各地的沿海盐田和内陆盐水湖泊。由于在不同的离子浓度、气候环境以及高度下都可见其生存的痕迹，目前卤虫被大量用于内陆盐湖的生态多样性方面的研究。这些方面的研究为进一步在分子水平上研究其对环境适应性的遗传多态性提供了很好的实验素材。在过去的二十年里，对卤虫系统进化关系方面的研究主要集中在杂交实验、形态学比较、细胞遗传学、异型酶标记以及核和线粒体DNA序列标记方面。通过对世界不同地区的卤虫样品的收集，我们利用DNA Barcoding技术分析并构建了卤虫的系统进化关系。我们选择DNA Barcoding的标准序列标记来重建不同卤虫种的系统进化关系。此标准序列为线粒体COXI基因的一段648bp的DNA片段。我们最初的研究主要集中在分析中国高原和平原地区的卤虫种，进一步分析了高原不同地区间的盐湖卤虫群体的多态性，并发现了在高原Co Qen盐湖中卤虫在COXI基因的381bp位置上出插入缺失现象。结合对中国高原地区的DNA Barcoding分析，我们测序了高原卤虫代表的线粒体基因组。通过对13个编码蛋白基因的比较分析，我们进一步证实了在应用DNABarcoding分析系统进化时采用COXI基因片段的可靠性。