论文部分内容阅读
[目的]很多研究证实,肿瘤的发生、发展常常与某些相关基因的突变有关,近年来,基因检测技术已经开始应用到肿瘤患者的治疗当中。本研究是通过检测30例骨肉瘤组织和10例骨软骨瘤组织中PDGFRA基因突变的情况,并结合临床分析PDGFRA基因突变与骨肉瘤患者各种临床、病理因素之间的关系,以期找出有助于准确评估和改善骨肉瘤患者预后的基因靶点,为骨肉瘤的治疗及预后评估探索出新的途径。[方法]1.使用相应的试剂盒并按照其标准化的操作流程提取白2010年1月至2018年6月期间在深圳市第二人民医院骨肿瘤中心收集的30例骨肉瘤组织和10例骨软骨瘤组织样本中的DNA。2.根据Ion Amplise.q Library Kits 2.0标准化操作.方案构建并纯化DNA文库。3.根据Life Technology Cancer Panel标准化技术流程进行测序模板的制备与富集,然后在Ion Torrent平台上进行测序。4.分析测序的数据结果,采用卡方检验Fisher确切概率法分析探讨PDGFRA基因突变的情况与骨肉瘤患者的性别、年龄、肿瘤部位、病理类型、临床分期、病理性骨折、碱性磷酸酶水平、肺部转移、局部复发以及生存状态等因素的关系,采用Kaplan-Meier及log-rank检验分析PDGFRA基因突变情况与5年总体生存期的关系。[结果]1.30例骨肉瘤组织样本中有22例样本检测出PDGFRA基因发生突变,PDGFRA基因总突变率为73.3%。2.10例骨软骨瘤组织样本中没有检测到PDGFRA基因突变。3.30例骨肉瘤组织样本中共检测出PDGFRA基因突变的位点有2个,分别是第4号染色体第55141050、第4号染色体第55152040,其基因突变的突变率分别是33.3%、40%。其中第4号染色体第55141050位点发生的基因突变为缺失但没有导致移码突变,第4号染色体第55152040位点发生的基因突变为同义突变。4.PDGFRA基因第4号染色体第55141050位点在无复发的患者中突变率为10%。在复发的患者中突变率为23.3%。骨肉瘤复发的患者的PDGFRA基因第4号染色体第55141050位点突变率明显高于无复发患者,差异具有统计学意义(P =0.045,<0.05),但是PDGFRA基因第4号染色体第55141050位点突变在骨肉瘤患者性别、年龄、肿瘤部位、病理类型、临床分期、病理性骨折、肺部转移及碱性磷酸酶水平等因素中的突变率均无统计学差异(P>0.05)。PDGFRA基因第4号染色体第55141050位点发生突变在存活患者中的突变比例为13.33%。在死亡患者中的突变率为20%。死亡患者的PDGFRA基因第4号染色体第55141050位点突变比例明显高于存活患者,差异具有统计学意义(P =0.007,<0.05)。[结论]骨肉瘤组织中PDGFRA基因突变率较高,PDGFRA基因第4号染色体第55141050位点在骨肉瘤复发患者的突变率明显高于无复发患者,且该突变在死亡患者的突变比例明显高于存活患者,具有该突变的患者5年总体生存期要显著低于无该突变的患者,揭示了PDGFRA基因第4号染色体第55141050位点突变可能是骨肉瘤患者预后不良的一个标志;PDGFRA基因第4号染色体第55141050位点可能成为骨肉瘤基因治疗和靶向治疗的潜在靶点,可能是评估骨肉瘤患者生存预后的一个标志。