高致病性PRRSV GD07a株和GX07a株的分离鉴定及其基因变异研究

来源 :华南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:myzhijun
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猪蓝耳病又称猪繁殖与呼吸综合征(Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome,PRRS),自1996年在我国证实存在以来,在我国各个地区已经普遍流行,该病主要引起母猪繁殖和仔猪呼吸障碍,使猪生产力下降。2006年开始全国流行的“高热病”被证实由猪蓝耳病病毒(Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome virus,PRRSV)引起,该病毒具有高致病力,可引起猪大批量死亡,严重危害我国养猪业的可持续性发展。 本研究采集广东和广西疑似高致病性PRRS病死猪的肺脏各1份,对2份病料进行PRRSV检测,结果2份均为阳性。病料经过处理后,接种MARC-145细胞,2份病料均产生典型的细胞病变,连续传至第4代,细胞病变稳定。抽提病毒培养液中的RNA作为模板,经RT-PCR均可检测出PRRSV。对分离出的2个高致病性PRRSV分别命名为PRRSV GD07a株和GX07a株。 用PRRSV变异株的实时荧光RT-PCR试剂盒对GD07a毒株和GX07a毒株进行荧光RT-PCR检测,结果均为阳性,说明GD07a毒株和GX07a毒株均是PRRSV变异株。用PRRSV GD07a株的纯化病毒接种4头一月龄健康小猪,攻毒量为107.1TCID50。猪群第二天发病,发病率为100%(4/4),10 d后开始死亡,死亡率为75%(3/4)。说明该毒株对猪具有高度致病性。 参照GenBank中已发表的PRRSV CH-1a株的Nsp2基因序列,利用Primer 5.0软件,设计合成了一对包含Nsp2部分基因核苷酸序列的特异性引物PN1/PN2,扩增序列的预计长度为886 bp。通过RT-PCR方法扩增了GD07a毒株和GX07a毒株的Nsp2部分基因核苷酸序列,将PCR产物纯化后克隆到pMD18-T Simple Vector中,然后转化细菌DH5α,转化菌的菌液经PCR鉴定后进行序列测定,测序结果显示该Nsp2部分基因长度均为796 bp,比预计的序列长度少了90个碱基,与目前有关报道关于高致病性PRRS变异株的Nsp2基因分析符合。应用DNASTAR分析软件与GenBank上已发表的其它毒株序列进行核苷酸同源性分析。结果显示GD07a毒株和GX07a毒株的Nsp2部分基因核苷酸序列之间的同源性为99.1%,与国内已发表的13株高致病性PRRSV的核苷酸同源性为98.0%-99.6%,而与PRRSV经典株VR-2332、CH-1a、LV的核苷酸同源性分别为71.6%-71.7%、81.3%-81.4%、47.5%-47.6%。 参照GenBank中已发表的PRRSV CH-1a株的Gp5基因序列,设计合成了一对包含Gp5全长的特异性引物PG1/PG2,扩增序列的预计长度为603 bp。通过RT-PCR方法扩增出GD07a毒株和GX07a毒株的Gp5基因。测序结果显示Gp5基因全长均为603 bp,编码201个氨基酸。应用DNASTAR分析软件与GenBank上已发表的其它毒株序列进行核苷酸及其推导氨基酸同源性分析,结果表明GD07a毒株和GX07a毒株的Gp5基因的核苷酸序列之间相似性为99.5%,推导的氨基酸序列之间的相似性为99.5%;与国内已发表的7株高致病性PRRSV的核苷酸相似性为98.7%-99.2%,与国内已发表的7株高致病性PRRSV的氨基酸的相似性为98.0%-99.0%;而与PRRSV经典株VR-2332株、CH-1a株、LV株的核苷酸相似性分别为89.9%-90.0%、94.9%-95.0%、62.5%-62.9%,与经典株VR2332株、CH-1a株、LV株的氨基酸的相似性分别为89.6%-90.0%、92.0%-92.5%、57.2%。Gp5基因的核苷酸遗传进化树分析表明,本研究分离得到的GD07a毒株和GX07a毒株均属于美洲型毒株,与其它7株已发表的高致病性PRRSV同源性高,同属一个小分支。 目前,关于高致病性PRRSV Gp5基因的限制性片段长度多态性(RFLP)图谱,国内还没有相关的报道。本研究对高致病性PRRSV GD07a株和GX07a株的Gp5基因进行RFLP分析,利用MluⅠ、SacⅡ、HaeⅢ、MspⅠ四种酶进行限制性内切酶反应,结果表明GD07a毒株和GX07a毒株的酶切图谱均为1-2-2-2,该结果为国内首次报道。
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