为了了解南麂列岛国家级海洋自然保护区核心区内外大型底栖藻类的生物多样性,在2016年2月至2017年11月,共8个次在南麂列岛布设11个断面对潮间带大型底栖藻类进行了采样,对所得数据进行分析,主要研究大型底栖藻类的物种组成、区系、生物量的空间分布,并运用Shannon-Wiener多样性指数、Pielou丰富度指数和Margalef均匀度指数分析藻类生物多样性。结果表明:共鉴定出大型底栖藻类76种,其中红藻门种类最多有50种,褐藻门有12种,绿藻门有13种。根据其适温性分析,该调查区域的大型底栖藻类以暖温带种类为主,占总种类数的72%;其次是亚热带种,占总种数的21%。四季藻类总平均生物量分布变化春季最高为617.71 g.m^-2,秋季最低为176.59g.m^-2,藻类生物量主要分布在中潮下层和低潮带。南麂列岛总平均Shannon-Wiener多样性指数（H′）为0.74,丰富度指数（D）为0.73,均匀度指数（J′）为0.45,2016与2017年的平均Shannon-Wiener多样性指数（H′）、丰富度指数（D）和均匀度指数（J′）均是春季最大,冬季次之,夏季与秋季较低。对比核心区与实验区内大型底栖藻类平均物种数、生物量、多样性指数,均是核心区高于实验区,总体上来说核心区的强化保护取得了一定的效果。