预算绩效评价以财政预算为评价对象,以支出结果为目标导向的一种评价手段,是预算会计的重要组成部分。2018年中央提出实施全面预算绩效管理以来,各级各地政府高度重视,大力开展绩效评价工作,然而目前由于公共部门缺乏科学化的决策工具和战略意识,导致绩效评价工作开展质量不高,难以真正起到约束财政资金的作用。尤其是部门整体预算绩效评价,涉及范围更广泛、评价层次更深入,如何跨越当前评价体系的藩篱,构建科学合理的部门整体预算绩效评价指标体系,不仅从理论研究层面来说极为必要,从实务操作层面来说也亟需厘清。笔者以深度参与的X市中医管理部门重点评价项目为例,指出财政部基于逻辑模型（LM）的指标框架存在诸多局限,导致实务中的部门绩效评价工作常常落入管窥蠡测的窠臼。为打破这一桎梏,本文立足实务基础,借鉴国际经验,守正创新,吸收了平衡计分卡（BSC）的核心内容,将传统的四个维度优化为财政预算管理、公共服务、部门管理、可持续发展能力四个新的维度,提出了对现有指标体系框架的优化路径,重新研发设计了新的绩效指标,并借助层次分析法科学分配指标权重,设计了一套远期规划与年度计划并重的部门绩效评价指标体系。然后将基于LM与基于BSC的两套指标体系的应用情况进行对比分析,指出了BSC应用于部门绩效评价的优越性,更能反映部门的工作实绩。最后针对绩效评价结论提出了部门在科学编制预算和加强绩效管理方面的相关建议,旨在为部门科学决策提供参考建议。