红桦(Betula albosinensis)和白桦(Betula platyphylla)广泛分布于我国云南、四川、陕西、甘肃、河南及山西。在两个物种同域或邻域分布的种群中,有一些疑似杂交个体。本研究使用12个核微卫星位点对9个地点的391个桦树个体开展分子标记;对部分采集的桦树开展叶片形态学分析;对微卫星数据开展了PCO分析和STRUCTURE分析以推测种间杂交、种群遗传结构和遗传混合;比较了区分“四倍体”红桦基因型和不区分“四倍体”红桦基因型对群体遗传分析的影响;分析了倍性及物种丰富度对红桦和白桦之间基因渐渗方向的影响。主要研究结果如下:1、基于叶形态的表型分析将样本分为红桦和白桦,但分子标记的结果表明红桦具有四倍体和二倍体个体,并且二倍体同四倍体已产生了明显的遗传分化。2、基于ITS序列的系统发育表明,大多数“二倍体”红桦与“四倍体”红桦聚为一枝,但是支持率较低。3、基于微卫星数据的STRUCTURE分析表明白桦和“四倍体”红桦之间以及“二倍体”红桦和“四倍体”红桦之间杂交率及基因渐渗的量较低。六个个体为“四倍体”红桦和“二倍体”红桦之间早期杂交后代或回交个体。五个个体为“四倍体”红桦和白桦之间的早期杂交个体。4、基于遗传混合量分析表明“二倍体”红桦和白桦渐渗到“四倍体”红桦的量同纬度无显著的相关性。物种丰富度和倍性差异不影响红桦和白桦之间的渐渗方向。不完全的谱系分离和基因流可以解释遗传混合在地理分布范围的分布规律。5、区分“四倍体”红桦基因型和不区分“四倍体”红桦基因型对物种之间的遗传分化没有显著影响但不区分“四倍体”红桦基因型的遗传结构被低估。