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本试验采用SSR分子标记分析51份白粒玉米自交系遗传多样性,利用UPGMA聚类分析法进行聚类,对51份玉米自交系材料亲缘关系进行初步划分,并从中选取有代表性16份自交系为材料,采用NCⅡ遗传交配设计,组配60份杂交组合,通过一年3点(安顺、贵阳、凯里)联合鉴定,对16份白粒玉米自交系15个主要农艺性状配合力及杂种优势进行研究,结果如下:1、SSR分子标记分析表明:35对核心引物共检测到155个等位基因,变化范围为2-8,平均为4.42个。每个等位位点多态性信息量(PIC)变化范围为0.4926-0.8749,平均为0.7365。51份白粒玉米自交系遗传相似系数(GS)变幅为0.2129-0.9419,平均为0.4607。按UPGMA聚类分析法进行聚类,当阈值为0.43时,将51份白粒玉米自交系划分为6大类群。2、联合方差分析表明:3个试验点间,除茎粗、穗长、行粒数差异不显著外,其他性状达到显著或极显著水平,组合、试验点与组合互作效应各性状均达到极显著水平;P1(测验种)GCA方差除茎粗、穗位叶叶宽、雄穗主轴长度、穗长、秃尖及百粒重差异达不到显著水平外,其他性状均达到显著或极显著水平,P2(被测系)的GCA的方差除穗位叶叶宽、秃尖和出籽率不显著外,其他性状均达到极显著水平,P2(被测系)×P1(测验种)的SCA方差显示,15个性状差异均达到极显著水平,说明在不同试验点、不同组合在多数性状之间的差异是真实存在的。3、对16份白粒玉米自交系一般配合力分析表明:325在单株产量等综合性状的GCA表现较为突出,用325作为亲本易配出综合性状好、抗倒伏性强、穗长长、果穗大、百粒重重的高产杂交种;用343易配出行粒数多、穗长长、雄花分支数多及雄花主轴较长,秃尖小的杂交组合;用331易配出穗长长,百粒重大的高产组合;用368可配出穗行数多、果穗大的组合;用373易配出行粒数多、穗长较长的组合,而其他GCA不高的自交系,在应用过程中应加以改良。4、对60份杂交组合特殊配合力分析显示,不同性状间配合力均呈正负效应且变异范围之间有较大的差异,其中单株产量正效应组合33个,变幅为-17.90~17.90,组合368×344效应值最高;穗行数正效应组合26个,变幅为-8.12~11.20,组合368×329效应值最高;行粒数正效应组合30个,变幅为-8.77~6.68,331×323效应最高;百粒重正效应组合30个,变幅为-11.37~13.19,331×324最高;出籽率正效应组合34个,变幅为-5.88~3.15;穗长正效应组合30个,变幅为-9.17~8.52,341×326效应最大;穗粗正效应组合31个,变幅为-9.17~8.52,327×324效应最大;茎粗正效应组合33个,变幅为-12.72~9.99,344×326效应最高;株高正效应组合30个,变幅为-6.55~6.12;穗位高正效应组合33个,变幅为-9.26~21.21;穗位叶叶长正效应组合31个,变幅为-10.19~7.73;穗位叶叶宽正效应组合25个,变幅为-8.74~10.89;雄花分支数正效应组合32个,变幅为-23.46~32.48,雄花主轴长度正效应组合28个,变幅为-13.42~8.33。5、以单株产量与总配合力效应值、一般配合力、特殊配合力进行相关分析表明,单株产量与其总配合力效应呈显著正相关(R2=0.982),单株产量总配合力效应大小顺序与产量结果高低的排列基本一致;单株产量及其总配合力与母本一般配合力、父本一般配合力和特殊配合力呈显著正相关,且相关系数大小接近;一般配合力与特殊配合力无相关关系。6、以贵农玉889为对照,分析60份杂交组合单株产量对照杂种优势,结果表明:325×329、325×324、340×324、368×329、325×323、373×324、331×323、325×344、331×324组合比对照增产5%以上,其中组合325×329增产19.89%,325×324增产18.57%,340×324增产12.69%,368×329增产12.32%,这4个组合增产均在10%以上,属于具有较强杂种优势的组合。被测系325、331、340、368等与测验种324、344、323、329等组配获得高产组合的可能性较大,具有较大的利用潜力。7、16份自交系SSR分子标记与特殊配合力聚类分析表明,两种聚类方法结果基本与系谱来源一致,但也有个别材料有所偏差,原因可能与两类方法所基于的基础数据差异形成,SSR分子标记受环境条件的影响较小,其聚类准确性高于SCA聚类分析。