真菌中ICK结构多肽的新基因发现、功能鉴定与进化分析

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含有抑制剂胱氨酸结(ICK)基序的多肽在动物和植物中普遍存在,发挥着各种各样的生物功能。一些ICK结构多肽的功能是杀真菌或杀细菌成分,它们将作为抗微生物多肽(AMPs)后备资源的一部分,用于打破抗生素诅咒。但是目前在真菌中对此种类型多肽开展的研究甚少。在本研究工作中,运用数据挖掘技术从真菌基因组数据库识别出386个新的含有ICK基序的多肽或蛋白质。在这些真菌多肽中共计包含506个ICK结构基序,一致性序列总结为CX4-7CX2-12CCX2-6CX4-19C。根据结构域的架构特征,这些分子被分成3种不同的结构类型,包括265个单一结构域的ICK结构多肽(sICKs)、66个结构域串联重复的ICK结构蛋白质(rICKs)和55个结构域融合的ICK结构蛋白质(fICKs),其中有6个家族的真菌ICK结构多肽与动植物ICK结构多肽的序列和结构显示出显著的相似性,例如长臂天牛中的抗真菌Alos。所有真菌中新发现的ICK结构多肽或蛋白质具有多变的基因结构,且它们广泛分布在不同的物种之中。此外,预测到fICKs拥有各种融合结构域。基于序列分析、结构模拟和表面电荷分布的组合证据,选取球孢白僵菌中含有Beabasin-2A和Beabasin-2B的双域ICK结构多肽在大肠杆菌中建立蛋白质重组表达体系并评估它们的实际抗真菌活性。目前已经得到大量的融合蛋白,正在尝试酶切实验获取目标ICK结构多肽。构建系统进化树表明,来自真菌、动物和植物中的ICK结构多肽具有直系同源关系。有趣的是,新发现的真菌ICK结构多肽与已往的ICK结构多肽不同,它们可能经历了基因复制、结构域复制、基因融合和外显子重排,形成了高度的分子多样性。此项研究不仅扩展了多细胞生物中ICK结构多肽的数目,而且揭开了它们在某一特定家系中的复杂进化历史。
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