随着互联网技术的快速发展，办公自动化系统在电子政务中应用越来越广泛。但以工作流为核心的办公自动化系统已经远远不能满足企业信息现代化建设的要求，那么如何设计一个以知识管理为核心的协同办公系统，是目前重点研究的课题。本文设计的协同办公系统，通过企业中人与人、人与部门、部门与部门之间信息的收集、组织、交流等行为有效地实现整体管理目标，提高了企业的办公效率。 本文深入研究了基于J2EE平台的第三代协同办公系统架构及相关技术，重点介绍了EXOA2005协同平台应用功能的分层实现，开发了一种基于公文流转的协同办公自动化系统。在以工作流为核心的基础上使企业实现了协同办公，同时为满足现代信息化管理的要求，对此平台进行了功能扩展与优化。 在平台设计方面从软件工程的角度出发，针对公文流转业务对系统进行需求分析，并抽象出数据对象模型。本文采用时序图和状态图等方法来说明主要业务流程，设计并实现了公文流转中表单定制和流程定制的功能模块。并对表单定制结果所采用的XML解析方法、流程定制所采用的图形化方法等提出了合理化意见，从而能够更好地满足用户需求和产品化设计。 本文所设计的协同办公自动化系统已经在广东省烟草专卖局中成功应用，具有较好的效果，很好的满足了当代企业协同办公的要求，具有广阔的市场前景。