里氏木霉是一种已在工业生产中被广泛应用的丝状真菌。它具有生长迅速，蛋白分泌性强，蛋白生产后加工修饰功能较完整等诸多优势。　　以往针对里氏木霉的改造，都局限于提高其中纤维素酶活而进行的随机紫外诱变等非基因工程方法，这些改造中一部分取得了良好的效果，获得了RUT-C30等菌株。然而，在如今已经获得里氏木霉基因组，以及里氏木霉基因改造方法——农杆菌介导的结合转移方法后，我们可以更加准确方便的对里氏木霉进行宿主改造，直接获得我们需要的菌株表型。人们对于里氏木霉作为宿主表达异源蛋白的一直抱有很大的希望，但是结果都不太令人满意。在对这种现象进行分析，并且结合一些文献报道，我们发现瓶颈很可能是由里氏木霉自身产的蛋白酶引起的。通过文献查阅、相似序列比对，我们从里氏木霉RUT-C30菌株中找到验证了三种蛋白酶:丝氨酸蛋白酶，天冬氨酸蛋白酶以及液泡蛋白酶。在预实验中，我们通过对序列的信号肽分析，荧光定量PCR分析，最终选择了以敲除其中的丝氨酸蛋白酶作为改造里氏木霉RUT-C30的第一步。　　在改造之前，我们构建了一个用于基因敲除的通用质粒，帮助今后实验能够更快更有效的进行;对里氏木霉的筛选标记进行了改造，从而使其应用限制性大大降低;在进行了充分的预实验之后，我们成功的将里氏木霉中的丝氨酸蛋白酶进行了敲除。并在敲除之后，获得了里氏木霉胞外蛋白酶活性下降50％，里氏木霉内切纤维素酶活性提高25％～30％的良好效果。　　同时里氏木霉作为一个优良的基因库，而蛋白酶又是工业产酶中最重要的一种酶类，我们尝试将里氏木霉源的丝氨酸蛋白酶进行异源表达。在以毕赤酵母为宿主时，获得了53U/mL的酶活量，具有较大开发潜力。