2008年1月16日，国家批准实施《广西北部湾经济区发展规划》，标志着北部湾经济区正式纳入国家开放开发发展战略。北部湾经济区是由南宁、北海、钦州、防城港加上崇左和玉林“4+2”模式组成的经济区，它位于华南、西南和东盟经济结合部，是我国唯一既沿海又沿边的区域，具有重要的区位优势和资源优势，国家的战略是致力于将广西北部湾经济区建设成为重要的国际国内经济合作区。这种跨区域的合作模式和我国大多数区域合作初期一样面临着协调困难、资源重构浪费等问题，本文认为有效解决这些问题关键是要探索出一条适合北部湾经济区区域发展的行政管理与机制创新道路。行政管理体制与机制改革是政治体制改革的先导和重要组成部分，通过制度化设计能比较有效地解决区域行政一体化与行政区经济、区域管理与区域公共治理的矛盾，为区域经济社会统筹发展营造良好的体制机制环境。2008年国务院的政府机构改革首次将“大部制”理论引入改革理念中，为治理政府职能转变不到位、机构重叠、权责不一致等政府机构低效问题指明了方向，有助于构建一个“小政府、大社会”、“宽职能、少机构、高效统一”的政府治理模式。“大部制”改革的首要和最终目标是追求公共利益、实现公共服务、改善民生、促进社会和谐、建设服务型政府，这个目标正好和我国政府机构改革以及广西北部湾经济区的发展目标是相一致的，所以本文立足于“大部制”改革理论来探求北部湾经济区的行政管理体制与机制架构。本文通过文献分析法、比较分析法和实证分析法，沿着“提出问题——分析问题——解决问题”的研究思路，就如何构建和创新北部湾经济区行政管理体制与机制从“大部制”理论视角加以分析，以科层制理论、公共选择理论、企业家政府理论和新公共服务理论等相关的行政学理论为指导，在借鉴国内外大部门体制先进经验的基础上，对北部湾经济区行政管理体制与机制现状、面临考验和原因进行分析，结合理论和实践层面提出相应的对策建议。本文将“大部制”理论与北部湾经济区的行政改革实践结合起来，这对于优化解决广西北部湾经济区经济建设、政府间合作和区域公共管理等问题具有一定的理论意义，同时也对于丰富具有中国特色行政体系理论研究有一定的理论意义。