我国是荔枝起源中心,拥有丰富的荔枝种质资源。野生荔枝是荔枝改良利用的丰富基因来源,它们主要分布在广东、广西、海南、福建等地,其中海南野生荔枝是我国荔枝种质资源的重要基因库之一。国内已经有利用分子标记对海南野生荔枝遗传多样性进行研究的报导,但对于海南野生荔枝遗传多样性的ISSR分析未见研究报导。本实验分别采野生荔枝,半野生荔枝和栽培荔枝共96份样品材料,利用ISSR标记技术进行遗传多样性及亲缘关系分析。获得如下结果:1、通过对dntps、primer、DNA模板及Taq酶用量的优化,获得适用于本实验的ISSR-PCR反应体系。2、从23条ISSR引物中筛选出的13条多态性引物,并通过对96份样品材料进行ISSR扩增,共检测得到180个基因位点数,多态性位点为163个,多态性比例为90.56%。3、用NTSYS软件对61份野生荔枝样品的ISSR产物进行分析,其相似系数在0.68-0.89之间,表明该群体的遗传多样性水平不高。在相似系数为0.71水平上,61份野生荔枝种质可以分为7个类群,结果与传统的以果皮龟裂片峰隆起类型为分类标准的分类结果不一致,来自不同采样地点各样品的遗传距离与地理距离也无明显相关性。有些类群含样品数少,被单独分出来的原因可能是含有特殊基因型,具有进一步研究的价值。4、对96份样品材料进行NTSYS软件分析并获得UPGMA聚类图,在相似系数约0.71水平上分为8个类群,其中野生荔枝覆盖所有类群,半野生荔枝存在于4个类群,而栽培荔枝全部集中在一个类群内,表明从野生、半野生到栽培类型荔枝基因型逐渐趋向单一,显示了三个类型的荔枝种质之间的逐步演化的关系和遗传多样性水平逐渐降低。此外,本实验还对海南野生荔枝资源的保护、利用对策进行了讨论。