铜绿假单胞菌毒性噬菌体PA-YS35的分离鉴定及全基因组序列分析

来源 :吉林大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:erapple
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)是革兰阴性非发酵需氧菌,普遍分布于泥土,生活用水及医院与工业废水中。作为引起伤口化脓性感染的主要致病菌之一,在机体免疫功能降低时,会引发多种疾病,如术后引起伤口感染,同时也可引发脓肿、褥疮、化脓性中耳炎等疾病。随着多重耐药性的菌株不断地更新换代并生成新的生物膜,临床治疗的难度进一步增大。噬菌体作为生物型治剂,重新走入人们的视线。噬菌体是一种浸染细菌的病毒,其遍及自然界各处。随着耐药性细菌变异速度的加快,噬菌体疗法(Phage Therapy)引起了科研学者们的兴趣及一些科研机构的重视。本实验临床分离得到宿主菌后,采用传统的双层琼脂噬斑法在吉大一院医院废水中分离得到毒性噬菌体,并将其命名为PA-YS35。电镜观察显示,噬菌体PA-YS35属于有尾噬菌体目(Caudovirales Order)、肌尾病毒科(Myoviridae family)噬菌体。生物学特性研究发现:(1)PA-YS35头部呈立体对称、直径约45nm,尾部和头部长度相仿、约为45-50nm;(2)PA-YS35的基因组为双链DNA,限制性内切酶图谱分析表明,基因组含有Eco RⅠ,Eco RⅤ,HindⅢ,NdeⅠ和XbaⅠ等几个酶切位点;(3)PA-YS35具有广谱裂解性,30株铜绿假单胞菌临床分离株可高效裂解其中的21株;(4)噬菌体PA-YS35的最佳感染复数(Multiplicity of infection,MOI)为0.01;(5)一步生长曲线显示,PA-YS35有3分钟的潜伏期,爆发期持续21分钟,爆发量为380 PFU/cell;(6)经噬菌体稳定性实验发现,PA-YS35噬菌体在50℃-70℃和p H 4-9的范围内依然有较高的活性和裂解率。噬菌体基因组测序结果表明,噬菌体PA-YS35基因组为线性双链DNA、大小为93,296 bp,GC含量为49.35%,检测出11个t RNA相关基因,其平均长度为77 bp,总长度为850 bp,占基因总量的0.9111%。使用RAST进行基因注释,结果显示,PA-YS35基因组含有172个开放阅读框(Open Reading Frame,ORF),其中有41个可预测其功能,剩余的131个为未知的编码序列。使用RNA连接酶核苷酸序列进行进化树的绘制,发现噬菌体PA-YS35的基因组与铜绿假单胞菌噬菌体Pseudomonas phage PAK P1在同一个分支上,有着较近的进化关系。噬菌体PA-YS35的全基因组序列已提交至Gen Bank,登录号:MF974178.1。综上所述,噬菌体PA-YS35为毒性噬菌体,其潜伏期短,裂解效率高,有较宽的裂解谱和极高的环境适应能力(在50℃-70℃和p H4-9的范围内依然保持较高的裂解活性),可以考虑应用于耐药性的铜绿假单胞菌感染的噬菌体生物制剂的开发。
其他文献
在经济全球化的新形势下,提高自主创新能力是增强国家竞争力和实现可持续发展、实现科教兴国的必经之路,是建设创新型国家的战略选择。胡锦涛曾经指出,“功以才成,业由才广。
文章从房地产销售角度出发,对我国样板别墅室内设计的特点和价值取向进行了深入分析,并通过与普通别墅室内设计的比较,对样板别墅室内设计要点把控与实践应用进行了较为务实
本文对16-18世纪白银流入中国的情况进行了评估,指出,从明季到19世纪30年代, 西方国家为换取中国的丝绸、茶叶、瓷器,输入中国的白银高达5亿两以上。大量白银流入中国,促进了
会议
技术和需求是创新的两个重要来源。既然存在描述技术进步的轨道,也必然存在描述需求演化的轨道。对比现有学者在技术轨道方面的研究进展,显然需求轨道的研究仍然处于起步阶段
<正>吴岚附记:日本早稻田大学文学系千野拓政教授一直关注"青年亚文化"问题,在"轻小说"领域的研究已经历时数年,并在日本、中国、新加坡等地联合各地学者、研究者展开问卷调
基于扎根理论编码方法,根据37家苏州装备制造企业调研资料,分析提炼影响装备制造业技术创新效率的12个因素。以苏州装备制造业数据为样本,运用随机前沿分析法(SFA)测算苏州装
规划建设的巴西至秘鲁两洋铁路是沟通太平洋和大西洋的国际铁路通道,巴西采用1600mm宽轨、秘鲁采用1435mm准轨,两国铁路轨距不一致,需设置换装站进行货物换装。本项目主要以
油田开发中后期的水淹层定量评价与剩余油分布研究已成为一个十分重要而又亟待解决的问题。论文以江苏油田高6断块阜宁组一段(以下简称阜一段)和阜宁组二段(以下简称阜二段)
阅读是我们获取信息的重要手段,而写作则是我们向外表达自己的主要方式。一生中,我们通过各种各样的方式认识世界,表达自己。但我国素质教育起步较晚,目前的教育方式比较落后,学习
稳定表达野生型p53基因、tk1基因人骨肉瘤细胞株的建立与鉴定目的建立稳定表达外源性野生型p53基因、tk1基因的人骨肉瘤细胞(U-2 OS)株,为进一步研究野生型p53基因在骨肉瘤旁