扬州鹅PRL基因的序列克隆及其多态性与产蛋性状的关联分析

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催乳素(Prolactin,PRL)又称促乳素或生乳素,是一种蛋白激素。它可抑制垂体促性腺激素的分泌,而使禽类的卵泡发育停止,最终导致停止产蛋,对禽类的产蛋性能具有重要作用。PRL基因常被看作是影响禽类就巢性和产蛋性能的重要候选基因。因此,本试验以扬州鹅作为研究素材,克隆PRL基因的全序列,并对其进行SNP检测。主要结果如下:1、在基因组水平上成功克隆了扬州鹅PRL基因的部分5’侧翼区、外显子1、内含子1、外显子2、内含子2、外显子3、内含子3、外显子4、内含子4、外显子5和部分3’侧翼区等区段的核酸序列,其长度分别为671bp、67bp、1495bp、182bp、413bp、108bp、1389bp、180bp、1894bp、418bp、29bp,序列全长为6846bp。所得序列均已上传至GenBank,基因登录号为GU984377。2、在5’侧翼区发现一个TATA框,14个潜在转录因子结合位点。由于扩增的3’侧翼区较短,所以没有发现AATAAA序列。将PRL基因的CDS序列与马岗鹅、鸭、鹦鹉、鸡的相应序列进行同源性比对,发现其同源性分别为99.7%、98.6%、92.2%、93%;而其编码的蛋白序列与马岗鹅、鸭、鹦鹉、鸡的蛋白序列的同源性分别为99.6%、98.7%、92.2%、93.9%。3、本试验共设计9对引物,采用PCR-SSCP技术检测PRL基因的多态性,并对发现的多态位点分析不同基因型与扬州鹅试验群体产蛋性状的相关性。结果显示:(1)在内含子2上(即在转录起始位点下游1776、1777位点)发生了GA碱基的插入/缺失,导致产生AA、AB和BB三种基因型。经卡方适合性检验,内含子2上的多态位点处于非Hardy-Weinberg平衡状态。该突变位点与扬州鹅产蛋性能的最小二乘分析表明,三种基因型的产蛋量和开产日龄差异不显著(P>0.05),但是不同基因型对应的最小二乘平均值的关系都是BB型﹥AA型﹥AB型。(2)在起始密码子上游+10处,发现一个突变位点。该突变位点是由鸟嘌呤G颠换成胸腺嘧啶T造成的,结果产生了两种基因型:分别为CC型和DD型。经卡方适合性检验,5’调控区的多态位点处于Hardy-Weinberg不平衡状态。该突变位点与扬州鹅产蛋性能的关联分析表明,CC型群体在一个产蛋周期内的平均产蛋量都极显著高于DD型(P =0.001),CC型群体在开产日龄上也是极显著早于DD型(P =0.001)。
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