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金丝猴作为国家一级珍稀保护动物,数量稀少,有极高的科研价值,现已被列为濒危物种。神农架金丝猴是金丝猴的一种,属于川金丝猴。我国政府已采取多种措施保护神农架金丝猴,人工补食计划是其中之一。人工补食计划的实施改变了神农架金丝猴原有的生活环境和饮食结构,必然会导致神农架金丝猴肠道菌群发生变化,由于肠道菌群与肠道健康密切相关,肠道菌群的失调有可能导致肠道疾病和其它非肠道疾病。因此,研究不同年龄阶段神农架金丝猴的肠道菌群组成,对监测金丝猴的肠道疾病和今后开展金丝猴专用人工饲料对肠道菌群的影响具有重要理论和实际指导意义。本研究共采集神农架金丝猴粪便样品47份。其中17份随机采集的样品用于变性梯度凝胶电泳技术分析,探索神农架金丝猴肠道菌群组成和多样性信息;另外30份样品来自三个不同年龄段的30只神农架金丝猴,用于16S r DNA的V4区高通量测序分析,得到三个年龄段神农架金丝猴肠道菌群组成和差异的信息,并将测得结果与其他物种的肠道菌群进行了比较分析。取得了如下结果:1.17份随机采集样品的变性梯度凝胶电泳分析结果表明:不同个体之间肠道菌群的多样性存在差异;主要优势菌门及比例:厚壁菌门(Firmicutes,55.6%)和拟杆菌门(Bacteroidetes,13.9%)。2.30份不同年龄段粪样高通量测序分析结果表明:神农架金丝猴肠道主要优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes,20.96%-30.29%)和拟杆菌门(Bacteroidetes,29.85%-39.46%);0-3岁组(Y1),5-8岁组(Y2),12岁以上组(Y3)肠道菌群含OTUs的数目依次为1469,1381,1931;菌门数目依次为16,16,19;属的数目依次为166,157,190;从不同年龄段肠道菌群OUTs数目比较可以看出:12岁以上组肠道菌群所含种类最多,肠道菌群最为丰富;UPGMA聚类分析表明0-3岁组(Y1)和5-8岁组(Y2)肠道菌群组成较为接近。3.神农架金丝猴肠道菌群与其他物种的比较分析结果显示,厚壁菌门和拟杆菌门是神农架金丝猴肠道和人、非人灵长类肠道共同的优势菌门,但在两者在3个物种肠道内所含的比例有差异(其中金丝猴为:57.88%-62.17%;人为:90%以上;非人灵长类70.50%-98.30);变形菌门在神农架金丝猴和人肠道中所占比例有较大的差异;螺旋体门是神农架金丝猴肠道的优势菌门,在人、非人灵长类肠道中为非优势菌门;神农架金丝猴肠道厚壁菌门以梭菌纲为主,且含有反刍动物特有的纤维杆菌门;神农架金丝猴的肠道中存在反刍动物特有的甲烷短杆菌。