药物代谢酶CYP2S1,CYP2R1和CYP2J2在中国不同民族群体遗传学研究

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药物基因组学(Pharmacogenomics)是一门研究个体间基因多态现象及其在不同药物效果差异的学科,它的出现推动了与药物代谢、作用靶点相关的基因和各种药物不良反应的相关性分析。同时,许多基因多态性位点也逐渐得到了关注,为临床个体化用药奠定了基础。细胞色素P450(cytochrome P450,CYP450)是人体内药物代谢酶系统中的主要一个家族酶系,在不同种群个体间代谢底物能力的差异,会导致个体在临床治疗效果和疾病易感性的不同,而成为了药物基因组的研究重点。现有的CYP450基因多态性研究,对于某些CYP450成员(CYP2Wl, CYP2S1, CYP2R1和CYP2J2)的相应数据在HapMap等公共数据库中的数据信息还很少。此外,近几年研究表明,CYP2S1, CYP2R1和CYP2J2这3种孤儿酶与肝、肾等器官的代谢、许多癌种的个体化治疗、预后或药物效应等都有很显著的联系。因此,这3个基因在中国不同民族中的基因多态研究,会有助于评估相关人群中疾病的发生风险预测和个体化用药。本文收集了150例(50例汉族、50例藏族和50例维族)无关个体样本,用直接测序法检测了CYP2S1, CYP2R1和CYP2J2基因部分启动子区域、全部外显子区域及相邻内含子区域。通过生物信息学方法,分析这3个基因多态性在不同民族间的分布特点及群体遗传学特征。实验结果表明:CYP2S1和CYP2J2基因中某些SNP位点在3个民族的分布有显著性差异,如:CYP2S1中v14(rs77631226),汉族与藏族、维族中信息存在很大的差异性(P<0.05);而CYP2R1中发现的SNP在3个民族中没有显著性差异(P>0.05)。CYP2J2中SNP的连锁关系最为紧密,CYP2S1次之。tagSNP的选取也有所不同,每个单体型在不同的民族中的分布频率有很大的差异(P>0.05)。用主成分分析和聚类分析,可以直观看出不同基因在3个民族分布的差异。利用软件进行蛋白功能预测时,发现CYP2S1 rs34971233(P466L)和CYP2J2*6 (N404Y),会使蛋白功能发生损害。总之,在不同中国民族中进行CYP2S1, CYP2R1和CYP2J2基因SNP位点的直接测序,可以丰富了CYP450数据库,并为这3个基因相关疾病的发生风险进行预测和个体化治疗提供依据。
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