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我们以前的研究结果表明苜蓿中华根瘤菌Rm1021中gtrA基因突变后,突变体gtrA出现自生和共生方面的缺陷表型。本论文对GntR家族转录因子GtrA的调控机理进行了初步研究。
生物信息学分析的结果表明GtrA与三叶草根瘤菌(Rhizobium leguminosarum bv.trifolii)中MatR的同源性达到64﹪,其上游四个连续基因分别是SMa0157、SMa0155、SMa0151和SMa0150,在其它细菌中发现了具有很高同源性的直向同源基因。其中SMa0151和SMa0150与三叶草根瘤菌MatA和MatB的同源性分别达到60﹪和75﹪。SMa0157和SMa0151与荚膜红细菌(Rhodobactercapsulatus)TRAP转运系统中DctP和DctM的同源性分别达到23﹪和31﹪。在三叶草根瘤菌中,matABC操纵子参与丙二酸的代谢,受到GntR转录调控因子MatR调控。因此,我们将gtrA邻近的基因分别命名为maW(SMa0157)、matQ(SMa0155)、MatMA(SMa0151)和 matB(SMa0150),推测matPQMAB很可能组成一个操纵予,参与苜蓿中华根瘤菌中丙二酸的运输和利用,并且受到GtrA的调节。
为了证明这一推测,首先将预测的matPQMAB基因簇启动子与lacZ基因融合,分别在野生型和突变体背景下测定自生和共生条件β-半乳糖苷酶活性,结果表明matP在自生和共生条件下都能被诱导,且丙二酸作为诱导小分子。matP、matQ、matMA和matB的突变体在以丙二酸钠为唯一碳源的M9培养基中不能生长,野生型能够生长,这些结果揭示matPQMAB基因簇参与苜蓿中华根瘤菌Rm1021中丙二酸代谢,并且是唯一丙二酸代谢途径。