本文以我国特有的珍稀濒危植物——崖柏（Thuja sutchuenensis）为研究对象。从崖柏生物生态学特性、组成群落的物种多样性、种群大小级结构、种群分布格局、种群遗传多样性等方面对其进行研究，旨在为崖柏这一珍稀濒危植物的有效保护提供科学依据。通过对现有分布区的调查和研究表明：（1）崖柏的生物生态学特征：该植物喜光，生长缓慢，耐瘠薄，主要生长于石灰岩山地，土壤类型多为棕褐壤，呈中性或弱碱性。（2）崖柏群落的物种多样性研究：崖柏能够成为群落乔木层的优势种或共优种。其物种多样性在崖柏群落垂直结构上的分布特点为：灌木层的物种丰富度大于草本层，草本层大于乔木层；物种多样性指数为灌木层﹥草本层﹥乔木层；物种均匀度为乔木层﹥灌木层﹥草本层。总体上，崖柏黄杨林（群落Ⅳ）丰富度和多样性指数最高；均匀度以群落Ⅰ（多齿长尾槭崖柏林）最高；群落中乔木层生态优势度﹥草本层﹥灌木层，整体的生态优势度以群落Ⅳ（崖柏黄杨林）最低。丰富度指数R2 对个体数目反应十分敏感，因此用该指数度量群落物种多样性时应谨慎使用。（3）崖柏种群大小级结构分析：崖柏种群各龄级间出现严重的断层现象，同时将崖柏种群划分为4个类型：增长型，始衰型，中衰型和老衰型。同时所有7个群落的调查表明，崖柏幼苗幼树个体死亡率高，故认为种群整体呈衰退趋势。（4）崖柏种群空间分布格局分析：崖柏种群表现为明显的集群分布，在取样尺度较小时（群落Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ为4m2；群落Ⅱ为6m2）集群强度最大，且随着取样尺度的扩大聚集强度逐渐减小。在各群落中集群强度以多齿长尾槭－崖柏群落（Ⅰ）最大，依次为崖柏－铁杉群落（Ⅱ），崖柏－巴东栎群落（Ⅲ），崖柏－黄杨群落（Ⅳ）最小。 （5）崖柏种群遗传多样性研究：与松杉目的其他植物种相比，崖柏种内多态位点百分率（77.27％）、Shannon遗传多样性指数（0.3992）和Nei基因多样性指数（0.2668）均属较高水平，因此认为崖柏种内具有较为丰富的遗传多样性；其中，群体内遗传变异占种内变异的大部分（Hpop/Hsp＝0.647），而群体间的遗传变异较小（（Hsp-Hpop）/Hsp＝0.353，Gst=0.3368）。其群体间基因流动贫乏，基因流Nm为0.4923，处于极低水平，遗传漂变成为刻划群体遗传变异的主要因素。同时遗传距离分析的结果表明，群体间的遗传距离与其空间距离相关性不大。总之，崖柏遗传多样性水平虽然较高，但人为干扰、基因交流贫乏以及幼树幼苗<WP=5>的高死亡率等因素都会使之难以自然更新,所以采取积极有效的保护措施已十分必要。