大豆(GlycinemaxL.)是当今世界上重要的食用油来源之一。我国是大豆的原产地，种质资源丰富、种类多、品质高、遗传多样性高。目前，在大豆脂肪酸代谢机理方面已经有一些研究，但这些研究多是从单个基因的角度，去研究脂肪酸的代谢途径，少有从大豆胚发育的角度，去研究脂肪酸合成代谢网络的报道。如何从这一复杂生化体系中找到关键的调控基因，阐明其生物学功能并朝符合人类需求的方向进行改造，对改良大豆脂肪酸组成提高油脂含量具有重要意义。“中豆32”和“油春02-6”是我国特有的大豆品种，两个品种的油脂含量分别为22.48％、17.72％，蛋白质含量分别为37.07％、44.07％，差异非常明显。利用抑制性消减杂交这一成熟的高效获得差异表达基因的技术，比较两个大豆品种发育过程中的基因表达差异，有利于筛选出调控油脂代谢的关键基因，为后期研究打下坚实的基础。课题主要研究如下： 利用抑制性消减杂交技术构建了以“中豆32”开花后36天胚为检测对象的正向cDNA文库和以“油春02-6”开花后36天胚为检测对象的反向cDNA文库。正反向抑制消减文库消减效率均在25以上，消减文库克隆经菌落PCR检测，有效重组率在90％以上，其中插入的cDNA片段大小在100bp到900bp之间，平均大小在434bp左右，构建比较成功。 通过对文库进行PCR和点杂交筛选，挑取了1337个阳性克隆进行测序，利用生物信息学对测序信息进行归并和分类，获得了32个在“中豆32”中高表达的特异基因和30个在“油春02-6”中高表达的差异基因。这些基因涉及到了蛋白质和油脂的合成、降解和转运，能量代谢以及胁迫响应几个方面。 通过对这62个基因进行不同组织表达情况的检测，得到了6个在胚中特异表达的基因，这6个基因分别为蔗糖结合蛋白、大豆种子成熟蛋白PM34、p24油脂蛋白B、脂氧合酶1、β-1，4-甘露糖苷酶和GDSL脂肪分解酶。为检测这6个基因在胚不同发育阶段的表达情况，用同样的方法分析了它们的时序表达情况。此外，还利用荧光定量PCR技术进一步分析了这六个基因在两个大豆品种中的定量差异。