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孔弄蝶属Polytremis隶属于弄蝶科Hesperiidae、弄蝶亚科Hesperiinae，刺胫弄蝶族Baorini，由Mabille于1904年建立，其模式种为Goiloba lubricans。全世界已记载18种，我国特有种11种。本属种类在外部形态上较为近似，种类鉴定需通过检验雄外生殖器结构。尽管刺胫弄蝶族的研究起步较早，但主要集中在形态学分类、区系分布和新种报道等方面。本文结合分子生物学的技术手段和形态学分类方法，首次对中国孔弄蝶属Polytremis构建分子系统发育树，研究线粒体及核基因的分子进化和变异，旨在为孔弄蝶属Polytremis的系统发育研究提供一定的参考。
本研究以孔弄蝶属18个性状特点作为分类指标，采用Spss13.0软件进行两步聚类分析，确定孔弄蝶属中各个变量的重要性。选用线粒体基因COI片段和核基因28s rDNA的D3区，18s rDNA的V4和V7区片段对中国产孔弄蝶属弄蝶67头标本，代表该属15个种进行检测，应用BioEdit v.7.0.5.3、ClustalX1.83、Mega4.1、PAUP4.0和MrBayes3.1等软件包进行序列比对和特征分析，并采用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)和贝叶斯法(BI)3种方法构建种间系统发育关系。此外，我们选取刺胫弄蝶族8个属，22个种，36个个体，并从Genbank中选取10条相关物种的序列辅助分析，尝试使用DNA条形码鉴定该族物种，旨在探讨将线粒体COI基因片段作为DNA条形码用于刺胫弄蝶族分类鉴定的可行性。主要结果和结论如下:
1.两步聚类结果显示，孔弄蝶属共分为3组，第一组中权重最大的性状是阳茎基柄区的粗细程度;第二组中权重最大的性状是翅正面斑纹发达程度;第三组中权重最大的性状则是翅正面半透明斑纹颜色。
2.根据COI基因部分序列构建的NJ树、MP树和BI树的结果表明其拓扑结构基本相同，均分为五支，与形态学聚类结果基本一致。此外，每个种的个体均能聚到一起，包括近期报道的物种天目孔弄蝶P.jigongi的两个单倍型没有和任何种混杂，被单独分出一枝。
3.与COI建的NJ树相比，核基因构建的NJ树不能将微点孔弄蝶P.gotama和紫斑孔弄蝶P.caerulescens分开，除了盒纹孔弄蝶P.theca的两个亚种，种内个体间的核基因都没有差别。盒纹孔弄蝶华东亚种P.thecafukia与指名亚种P.thecatheca的平均遗传距离为4.2％(K2P)，远大子该属种间的最小遗传距离1.7％(K2P)，由于这两个亚种被秦岭横断山脉所阻隔，推测有可能因地理隔离形成种间分化。
4.DNA条形码成功的鉴定出刺胫弄蝶族Baorini中的22个种，结果显示每个种的个体均能聚到一起，初步证明了COI片段可作为DNA条形码来鉴定该族蝶种。
5.拟籼弄蝶属Pseudoborbo与籼弄蝶属Borbo亲缘关系很接近，两者距离为3.7％(K2P)，远小于属间平均遗传距离11.28％(K2P)，甚至小于种间平均遗传距离4.13％(K2P)，因此拟籼弄蝶Pseudoborbo bevani可能应归属于籼弄蝶属Borbo，其分类地位有待进一步研究。