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目的探讨可以预测早期舌体鳞癌颈部淋巴结的病理因素、基因突变和蛋白水平改变,对淋巴结转移寻找可行的预测性指标;方法选取自2008年11月至2014年4月间221例cT1-2N0M0的随机对照临床试验的早期舌癌病例,进行临床病理分析;根据随机数表选取病例进行全外显子测序和转录组芯片筛选的方式分析与早期舌癌颈部淋巴结转移相关的细胞形态学、DNA和蛋白水平的预测指标,并对蛋白进行功能验证,结合临床数据,进行统计分析。结果早期舌癌颈部淋巴结转移与神经侵犯病理因素相关(p=0.004);转录组芯片发现107个特异性基因与转移相关,MFAP5和TNNC1在伴有颈部淋巴结转移患者中RNA表达和蛋白水平显著升高(MFAP5:p=0.0034;TNNC1:p=0.0142),并影响预后,采用MFAP5和神经侵犯联合预测指标可提高颈部淋巴结转移的预测效能。43例患者接受了全外显子测序:体细胞突变检测NOTCH1(p=0.007)和MUC20(p=0.035)与颈部淋巴结转移存在统计学差异;共22个基因的拷贝数发生变异,可联合应用预测淋巴结转移情况,其预测颈部淋巴结转移的ROC曲线平均曲线下面积达0.855;结论颈部淋巴结转移在病理形态学水平与神经侵犯相关;NOTCH1与MUC20是舌癌颈部淋巴结转移的差异体细胞突变,基因拷贝数变化可提示颈部淋巴结转移的风险;MFAP5的阳性表达可提示与颈部淋巴结转移和不良预后。联合预测指标MFAP5蛋白表达和PNI阳性对于早期舌癌颈部淋巴结转移具有预警意义。